More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2665 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  99.72 
 
 
360 aa  721  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.72 
 
 
360 aa  721  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.36323e-06  hitchhiker  1.1193e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  99.17 
 
 
360 aa  717  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.07575e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
360 aa  723  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  87.5 
 
 
360 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  87.5 
 
 
360 aa  618  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  1.41161e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  86.94 
 
 
360 aa  613  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  85.67 
 
 
361 aa  611  1e-174  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  86.94 
 
 
360 aa  610  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  66 
 
 
385 aa  477  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.32808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  66.2 
 
 
361 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  2.48395e-06  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2428  RND family efflux transporter MFP subunit  66.86 
 
 
361 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00201655  decreased coverage  1.51053e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1982  RND family efflux transporter MFP subunit  65 
 
 
360 aa  466  1e-130  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  5.42821e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  65.24 
 
 
361 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  64.86 
 
 
360 aa  454  1e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.90652e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1851  RND family efflux transporter MFP subunit  64.9 
 
 
361 aa  448  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000181813  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.91 
 
 
355 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  47.02 
 
 
349 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  39.47 
 
 
354 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  40.82 
 
 
353 aa  232  8e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  42.47 
 
 
392 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1440  secretion protein HlyD  37.98 
 
 
376 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.41 
 
 
368 aa  223  5e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 
375 aa  219  7e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01922  RND efflux membrane fusion protein  40.88 
 
 
318 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2322  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.84 
 
 
371 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437768 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 
374 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 
369 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.22351e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 
369 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  9.84298e-06  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 
369 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 
369 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.18856e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 
365 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  37.37 
 
 
354 aa  185  1e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1963  putative secretion protein, HlyD family  36.21 
 
 
390 aa  184  2e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  7.2673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  38.14 
 
 
371 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 
372 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 
382 aa  179  5e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 
364 aa  179  6e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  34.6 
 
 
366 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  33.55 
 
 
417 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 
388 aa  174  1e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  34.39 
 
 
369 aa  175  1e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 
390 aa  175  1e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0438  hypothetical protein  33.8 
 
 
352 aa  173  3e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.66929e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
370 aa  173  4e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 
382 aa  172  6e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
370 aa  172  8e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  32.46 
 
 
360 aa  172  8e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  32.58 
 
 
406 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  34.26 
 
 
375 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 
373 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  3.35121e-05  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  31.46 
 
 
369 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.60707e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  32.65 
 
 
382 aa  169  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0472  secretion protein HlyD  30.61 
 
 
359 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000402153  normal  0.138011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  33.75 
 
 
381 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.15 
 
 
376 aa  167  3e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  30.9 
 
 
365 aa  164  2e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.31 
 
 
375 aa  164  2e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  30.91 
 
 
365 aa  164  2e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.01532e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 
340 aa  163  4e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  31.27 
 
 
370 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.11518e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  30.81 
 
 
366 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.31728e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 
365 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 
365 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 
365 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 
365 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  32.78 
 
 
365 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  28.61 
 
 
380 aa  159  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 
365 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  32.45 
 
 
365 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01444  hypothetical protein  31.78 
 
 
350 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 
365 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  30.75 
 
 
376 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 
363 aa  153  3e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.67 
 
 
363 aa  153  3e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  1.5248e-07 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.7 
 
 
380 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.88 
 
 
362 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1969  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 
418 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.728278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.7 
 
 
366 aa  149  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  31.97 
 
 
415 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  28.89 
 
 
373 aa  148  1e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1266  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 
371 aa  147  2e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.2302e-07  hitchhiker  0.00027333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  29.51 
 
 
376 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  28.95 
 
 
351 aa  145  9e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  30.75 
 
 
371 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3371  secretion protein HlyD  31.94 
 
 
370 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165029  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.34 
 
 
351 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  28.65 
 
 
351 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2174  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 
394 aa  142  1e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.290725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  29.54 
 
 
328 aa  141  1e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1365  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 
370 aa  141  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  2.56097e-05  hitchhiker  0.000707959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2619  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 
405 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0944  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 
387 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  29.63 
 
 
373 aa  140  4e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  30.62 
 
 
467 aa  140  5e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1021  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.89 
 
 
390 aa  139  9e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0159772  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  27.73 
 
 
372 aa  139  9e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.12 
 
 
370 aa  139  9e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  29.02 
 
 
394 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.18 
 
 
362 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>