188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2641 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  99.47 
 
 
188 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  99.47 
 
 
188 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  99.47 
 
 
188 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  85.96 
 
 
171 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  83.62 
 
 
186 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2282  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  85.96 
 
 
171 aa  309  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.273788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  85.38 
 
 
171 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  85.38 
 
 
171 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1589  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  71.07 
 
 
167 aa  251  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  66.29 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  75 
 
 
171 aa  247  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  77.86 
 
 
181 aa  244  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  76.06 
 
 
179 aa  244  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.92 
 
 
194 aa  238  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  72.86 
 
 
165 aa  229  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3390  hypothetical protein  50.33 
 
 
157 aa  169  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.39 
 
 
171 aa  166  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3246  hypothetical protein  50.98 
 
 
160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  54.01 
 
 
187 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  53.64 
 
 
153 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3062  hypothetical protein  50.71 
 
 
158 aa  158  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00586635  hitchhiker  0.0000428896 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06766  hypothetical protein  52.55 
 
 
146 aa  152  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1113  hypothetical protein  51.45 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15840  hypothetical protein  46.99 
 
 
166 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4074  hypothetical protein  49.29 
 
 
171 aa  148  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1362  hypothetical protein  46.39 
 
 
166 aa  148  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0818746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1849  hypothetical protein  48.55 
 
 
166 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1461  hypothetical protein  47.86 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0524  hypothetical protein  43.27 
 
 
180 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0121  hypothetical protein  46.85 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1271  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.76 
 
 
187 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3411  hypothetical protein  42.94 
 
 
167 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.69027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0571  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.98 
 
 
334 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3771  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.24 
 
 
174 aa  138  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.18169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1008  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  46.67 
 
 
171 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.471796  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0272  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.53 
 
 
160 aa  137  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0839501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39640  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG-related protein  42.07 
 
 
168 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3494  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.71 
 
 
166 aa  136  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3990  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.1 
 
 
331 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.42 
 
 
337 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0044  hypothetical protein  47.48 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.421013  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.97 
 
 
331 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2684  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.72 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2505  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  47.86 
 
 
175 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.84705  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3505  hypothetical protein  47.83 
 
 
186 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.597399  normal  0.273252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3487  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  41.1 
 
 
341 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1451  hypothetical protein  44.6 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1056  hypothetical protein  39.33 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4168  hypothetical protein  39.23 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.620785 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2896  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.07 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.805979  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4270  hypothetical protein  44.6 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7151  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0071  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.06 
 
 
192 aa  124  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.867511  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4043  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.04 
 
 
169 aa  124  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3148  hypothetical protein  42.14 
 
 
182 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6003  hypothetical protein  41.67 
 
 
179 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0181  putative lipoprotein  39.63 
 
 
309 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0727  hypothetical protein  43.88 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.39665  hitchhiker  0.0000000755777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2578  hypothetical protein  39.71 
 
 
171 aa  117  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.633059  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2639  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.88 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.374361  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0707  hypothetical protein  38.65 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2862  hypothetical protein  39.88 
 
 
164 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1201  hypothetical protein  39.88 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.98306  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3472  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.3 
 
 
182 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0215767  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0649  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.85 
 
 
209 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3514  hypothetical protein  30.82 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00042974  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0914  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.86 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.942946  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.38 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.898539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0952  hypothetical protein  29.24 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.740863  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4656.3  hypothetical protein  56.36 
 
 
67 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.38 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0610  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 
388 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0723  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.11 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000201043  hitchhiker  0.00000128917 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0569  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family  29.11 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00260954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3294  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.34 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.37 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0541  hypothetical protein  27.67 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0087  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.86 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.81 
 
 
244 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.12 
 
 
449 aa  64.7  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4733  hypothetical protein  29.53 
 
 
462 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3306  hypothetical protein  28.66 
 
 
246 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635289  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5200  hypothetical protein  29.53 
 
 
462 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.86249 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0696  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.73 
 
 
244 aa  63.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3169  hypothetical protein  28.66 
 
 
246 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.65 
 
 
247 aa  62.8  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.364004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0893  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.43 
 
 
241 aa  62.4  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7577  transcriptional regulatory protein  34.06 
 
 
494 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3319  hypothetical protein  28.66 
 
 
246 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5418  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.92 
 
 
252 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5272  protein of unknown function DUF949  29.53 
 
 
475 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.910314 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0084  hypothetical protein  40.79 
 
 
122 aa  60.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.68 
 
 
415 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2917  hypothetical protein  28.77 
 
 
545 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.183325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3396  hypothetical protein  29.71 
 
 
246 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0219  hypothetical protein  29.71 
 
 
246 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  28.35 
 
 
244 aa  59.3  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0252  hypothetical protein  29.71 
 
 
246 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>