More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2537 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2073  histidinol dehydrogenase  86.27 
 
 
438 aa  766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2091  histidinol dehydrogenase  74.01 
 
 
433 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.538657  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1932  histidinol dehydrogenase  99.08 
 
 
433 aa  873    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2542  histidinol dehydrogenase  76.16 
 
 
439 aa  678    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2426  histidinol dehydrogenase  99.54 
 
 
433 aa  878    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  75.41 
 
 
443 aa  669    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2419  histidinol dehydrogenase  98.61 
 
 
433 aa  870    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2537  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
433 aa  880    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2179  histidinol dehydrogenase  97.92 
 
 
433 aa  863    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1799  histidinol dehydrogenase  86.81 
 
 
433 aa  771    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2178  histidinol dehydrogenase  87.04 
 
 
433 aa  771    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1719  histidinol dehydrogenase  71.99 
 
 
429 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1853  histidinol dehydrogenase  87.27 
 
 
433 aa  774    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.553413  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2457  histidinol dehydrogenase  71.93 
 
 
442 aa  632  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1617  histidinol dehydrogenase  71.69 
 
 
438 aa  625  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1942  histidinol dehydrogenase  67.9 
 
 
435 aa  579  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2410  histidinol dehydrogenase  57.97 
 
 
434 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  hitchhiker  0.000337345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2251  histidinol dehydrogenase  58.2 
 
 
434 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.849877  normal  0.226426 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2298  histidinol dehydrogenase  58.2 
 
 
434 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.219652  normal  0.0600324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2197  histidinol dehydrogenase  58.2 
 
 
434 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2300  histidinol dehydrogenase  58.2 
 
 
434 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0711798 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2953  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.525891  hitchhiker  0.00000000725252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1622  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
434 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.426183 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  56.81 
 
 
434 aa  491  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
434 aa  492  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1040  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
434 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.204161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  57.27 
 
 
434 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2159  histidinol dehydrogenase  56.35 
 
 
434 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1615  histidinol dehydrogenase  57.37 
 
 
435 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.217176 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  57.27 
 
 
431 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  57.54 
 
 
430 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  56.81 
 
 
436 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
443 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
443 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  56.58 
 
 
443 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  58.65 
 
 
413 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  57.04 
 
 
431 aa  484  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  55.2 
 
 
436 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  58.06 
 
 
436 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2011  histidinol dehydrogenase  56.35 
 
 
442 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.862973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1744  histidinol dehydrogenase  55.89 
 
 
442 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0770175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3890  histidinol dehydrogenase  55.79 
 
 
434 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150271  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1770  histidinol dehydrogenase  56.02 
 
 
428 aa  455  1e-127  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.381654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  55.09 
 
 
435 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0404  histidinol dehydrogenase  52.9 
 
 
437 aa  449  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1585  histidinol dehydrogenase  55.79 
 
 
428 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1951  histidinol dehydrogenase  55.56 
 
 
428 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0222803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2881  histidinol dehydrogenase  54.29 
 
 
438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  52.17 
 
 
434 aa  438  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  53.24 
 
 
428 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  50.84 
 
 
429 aa  418  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0098  histidinol dehydrogenase  50.23 
 
 
426 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000736266  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13980  predicted protein  50.35 
 
 
429 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  48.61 
 
 
427 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  50.6 
 
 
422 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  50.36 
 
 
429 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1757  histidinol dehydrogenase  49.77 
 
 
431 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.338237  normal  0.0340923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1784  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
429 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00833  histidinol dehydrogenase  50.93 
 
 
431 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000104597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3192  histidinol dehydrogenase  46.79 
 
 
430 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.405899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1352  histidinol dehydrogenase  49.08 
 
 
431 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1419  histidinol dehydrogenase  48.85 
 
 
431 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00797  hypothetical histidine biosynthesis trifunctional protein (Eurofung)  46.17 
 
 
867 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342936  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09670  histidinol dehydrogenase  47.49 
 
 
439 aa  359  4e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0576344  normal  0.0399309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0715  histidinol dehydrogenase  44.57 
 
 
429 aa  352  7e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000324572 
 
 
-
 
NC_006686  CND06120  histidinol dehydrogenase, putative  45.12 
 
 
852 aa  347  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89228  Histidine biosynthesis trifunctional protein  45.33 
 
 
867 aa  346  4e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.145236  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1201  histidinol dehydrogenase  44.72 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1207  histidinol dehydrogenase  44.5 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  44.13 
 
 
433 aa  333  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  45.75 
 
 
403 aa  323  4e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  43.61 
 
 
442 aa  322  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  44.78 
 
 
434 aa  322  7e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0855  histidinol dehydrogenase  43.75 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  42.96 
 
 
424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
445 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0239  histidinol dehydrogenase  47.06 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0183727  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0267  histidinol dehydrogenase  47.3 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0208  histidinol dehydrogenase  45.83 
 
 
434 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  44.74 
 
 
434 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  46.04 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  43.86 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0643  histidinol dehydrogenase  45.75 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  40.88 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  40.65 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  40.93 
 
 
433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0897  histidinol dehydrogenase  45.79 
 
 
431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  46.57 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  40.18 
 
 
429 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1231  histidinol dehydrogenase  43.92 
 
 
430 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4273  histidinol dehydrogenase  42.08 
 
 
438 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  46.42 
 
 
431 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  40.73 
 
 
429 aa  302  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2701  histidinol dehydrogenase  40.05 
 
 
434 aa  302  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  40.27 
 
 
429 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  40.27 
 
 
429 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  40.27 
 
 
429 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0107  histidinol dehydrogenase  41.2 
 
 
440 aa  301  2e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.981156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>