More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2531 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  52.85 
 
 
648 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  100 
 
 
680 aa  1395    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  98.49 
 
 
662 aa  1341    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  52.44 
 
 
657 aa  658    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  89.25 
 
 
649 aa  1185    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  90.34 
 
 
649 aa  1197    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  90.73 
 
 
653 aa  1212    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  98.49 
 
 
662 aa  1338    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  99.09 
 
 
662 aa  1345    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  87.32 
 
 
661 aa  1170    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  44.31 
 
 
640 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 
649 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  35.01 
 
 
659 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  34.81 
 
 
663 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  35.33 
 
 
650 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  34.81 
 
 
663 aa  326  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  35.33 
 
 
650 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 
663 aa  326  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  34.81 
 
 
663 aa  325  1e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  34.81 
 
 
663 aa  326  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  34.81 
 
 
663 aa  326  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  35.33 
 
 
650 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  35.18 
 
 
650 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  35.18 
 
 
650 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  34.33 
 
 
656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  35.07 
 
 
641 aa  320  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  33.58 
 
 
653 aa  303  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  32.26 
 
 
663 aa  295  3e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  31.96 
 
 
663 aa  290  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.95 
 
 
656 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  33.23 
 
 
635 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  31.34 
 
 
652 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  32.21 
 
 
666 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  31.96 
 
 
666 aa  280  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  31.96 
 
 
666 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  31.91 
 
 
666 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  32.11 
 
 
666 aa  276  8e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 
698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  32.21 
 
 
650 aa  267  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  30.63 
 
 
700 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  30.76 
 
 
653 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 
681 aa  260  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 
698 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 
698 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 
698 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 
713 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  31.23 
 
 
724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.87 
 
 
696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.11 
 
 
696 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  29.44 
 
 
655 aa  253  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  30.86 
 
 
724 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 
652 aa  252  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  31 
 
 
724 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  30.8 
 
 
724 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  30.66 
 
 
724 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 
695 aa  251  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 
702 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 
732 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  30.98 
 
 
680 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 
799 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.98 
 
 
703 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  29.06 
 
 
740 aa  246  8e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
658 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 
665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 
799 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
740 aa  242  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  29.86 
 
 
665 aa  240  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 
799 aa  239  9e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  29.86 
 
 
665 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  29.86 
 
 
665 aa  239  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 
726 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  29.75 
 
 
676 aa  233  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 
715 aa  233  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  29.93 
 
 
665 aa  230  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  28.59 
 
 
746 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  28.06 
 
 
698 aa  228  4e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  28.7 
 
 
696 aa  224  4e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 
714 aa  224  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  29.34 
 
 
744 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 
743 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.04 
 
 
744 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  28.27 
 
 
696 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  28.27 
 
 
702 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  28.74 
 
 
744 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  28.26 
 
 
746 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  28.1 
 
 
742 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 
739 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  27.94 
 
 
742 aa  207  6e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  28.34 
 
 
749 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3743  outer membrane receptor FepA  26.1 
 
 
766 aa  204  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.325826  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  27.62 
 
 
757 aa  203  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 
634 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.09 
 
 
746 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  30.28 
 
 
572 aa  195  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  26.73 
 
 
746 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  27.64 
 
 
777 aa  194  6e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
664 aa  191  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  28.23 
 
 
704 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  28.15 
 
 
697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  26.62 
 
 
783 aa  182  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>