20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2120 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2120  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000120456  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2073  hypothetical protein  96.65 
 
 
211 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0007392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0648  hypothetical protein  88.94 
 
 
208 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2660  hypothetical protein  59.61 
 
 
206 aa  261  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0656  hypothetical protein  59.02 
 
 
204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000158351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0781  hypothetical protein  59.02 
 
 
204 aa  251  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000208044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1659  hypothetical protein  50.75 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2721  hypothetical protein  47.55 
 
 
205 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.242146  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2914  hypothetical protein  43.72 
 
 
206 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0442485  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4126  hypothetical protein  43.22 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000019692 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0212  hypothetical protein  43.63 
 
 
212 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.017642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0652  hypothetical protein  42.93 
 
 
216 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2282  hypothetical protein  45.03 
 
 
151 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3062  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4520  hypothetical protein  35.57 
 
 
219 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.626432  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2116  hypothetical protein  34.88 
 
 
220 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1284  hypothetical protein  34.88 
 
 
220 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3030  hypothetical protein  31.44 
 
 
217 aa  118  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.82204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3691  hypothetical protein  29.36 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2279  hypothetical protein  44.07 
 
 
61 aa  52  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>