More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2031 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  50.64 
 
 		 3333 aa  2056    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2031  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2402 aa  4951    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.063176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2165  YD repeat-containing protein  57.88 
 
 		 2448 aa  2370    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1124  YD repeat-containing protein  64.7 
 
 		 2401 aa  2853    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1180  YD repeat-containing protein  64.6 
 
 		 2437 aa  2855    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.265366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3898  YD repeat-containing protein  66.44 
 
 		 2283 aa  2669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2167  YD repeat-containing protein  83.8 
 
 		 622 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0197  Rhs family protein-like protein  26.21 
 
 		 2413 aa  225  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  28.11 
 
 		 2497 aa  219  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3249  Rhs family protein-like  26.67 
 
 		 2513 aa  200  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3020  hypothetical protein  28.14 
 
 		 2762 aa  199  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.664598  normal  0.0507807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02048  hypothetical protein  35.67 
 
 		 583 aa  155  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1517 aa  138  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.06 
 
 		 1834 aa  137  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0053  YD repeat protein  23.06 
 
 		 2075 aa  136  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.192291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.53 
 
 		 1976 aa  134  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002889  Rhs family protein  29.68 
 
 		 2416 aa  134  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0160  YD repeat protein  31.55 
 
 		 2165 aa  133  5.0000000000000004e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02052  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1854 aa  124  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.09 
 
 		 1271 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  25.04 
 
 		 2117 aa  122  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.94 
 
 		 2096 aa  120  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0201  hypothetical protein  28.48 
 
 		 722 aa  119  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  23.84 
 
 		 2017 aa  115  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07080  hypothetical protein  27.45 
 
 		 2428 aa  114  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2453  YD repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1177 aa  101  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.16 
 
 		 2094 aa  101  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1840 aa  100  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  22.23 
 
 		 2138 aa  100  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2907  hypothetical protein  82.69 
 
 		 340 aa  99  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.621044 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.14 
 
 		 3027 aa  97.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.32 
 
 		 1953 aa  96.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.58 
 
 		 2149 aa  96.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  22.58 
 
 		 1981 aa  94.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 2035 aa  94.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1352 aa  94.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1237  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 628 aa  94  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.53 
 
 		 927 aa  93.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 1942 aa  92  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1433 aa  90.9  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.38 
 
 		 1467 aa  90.1  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1917 aa  87.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  24.47 
 
 		 738 aa  86.7  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.7 
 
 		 1959 aa  85.9  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  22.81 
 
 		 1381 aa  84.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1669 aa  84  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  22.35 
 
 		 2145 aa  83.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  22.32 
 
 		 1577 aa  83.2  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 1600 aa  81.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.37 
 
 		 482 aa  81.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 690 aa  81.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.71 
 
 		 788 aa  80.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.71 
 
 		 788 aa  80.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 2286 aa  80.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  22 
 
 		 1429 aa  79.7  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  21.96 
 
 		 1602 aa  79.3  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  23.72 
 
 		 903 aa  79.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  24.34 
 
 		 741 aa  78.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  23.03 
 
 		 2076 aa  77.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2224  YD repeat-containing protein  39.39 
 
 		 2494 aa  77  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1620 aa  76.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  23.48 
 
 		 1140 aa  76.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.12 
 
 		 1466 aa  75.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  27.24 
 
 		 474 aa  75.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.07 
 
 		 1599 aa  75.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  23.43 
 
 		 1147 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04723  RhsD protein  23.87 
 
 		 920 aa  75.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.370413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  22.04 
 
 		 869 aa  74.3  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  22.83 
 
 		 1568 aa  73.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 3073 aa  73.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1240  YD repeat-containing protein  27.72 
 
 		 1328 aa  73.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  27.05 
 
 		 554 aa  73.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  24.04 
 
 		 678 aa  73.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.47 
 
 		 889 aa  72.8  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  27.43 
 
 		 316 aa  72  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  23.7 
 
 		 2290 aa  71.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  27.43 
 
 		 298 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  24.18 
 
 		 1160 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  27.43 
 
 		 298 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1623 aa  70.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01748  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1230 aa  70.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  23.02 
 
 		 1427 aa  70.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  21.39 
 
 		 1609 aa  69.7  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 605 aa  69.7  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  24.27 
 
 		 840 aa  69.3  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  23.18 
 
 		 2246 aa  68.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  23.46 
 
 		 917 aa  68.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  23.19 
 
 		 2225 aa  69.3  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.95 
 
 		 2277 aa  68.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  24.27 
 
 		 2224 aa  67  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  22.17 
 
 		 1379 aa  67  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  24.27 
 
 		 2224 aa  67  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  23.59 
 
 		 1626 aa  67  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  23.98 
 
 		 2224 aa  67  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  23.01 
 
 		 2443 aa  67.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  23.07 
 
 		 1198 aa  66.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1935 aa  66.6  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  21.87 
 
 		 1492 aa  66.2  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.34 
 
 		 1530 aa  65.9  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  23.95 
 
 		 924 aa  65.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>