175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2028 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1978  integrase family protein  98.82 
 
 
422 aa  868  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.35719e-05  normal  0.0552843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3391  integrase family protein  99.05 
 
 
422 aa  872  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1861  phage integrase family protein  98.58 
 
 
422 aa  866  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00488759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3487  integrase family protein  98.58 
 
 
422 aa  870  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0968357  unclonable  8.80604e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3363  phage integrase family protein  98.1 
 
 
422 aa  867  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.267116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3254  phage integrase family protein  98.58 
 
 
422 aa  869  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2555  phage integrase family protein  98.1 
 
 
422 aa  866  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1973  phage integrase family protein  98.34 
 
 
422 aa  866  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2028  integrase family protein  100 
 
 
422 aa  877  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0404622  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3261  phage integrase  69.23 
 
 
417 aa  607  1e-172  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0304734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0775  integrase family protein  66.99 
 
 
418 aa  583  1e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0745  phage integrase family protein  66.99 
 
 
418 aa  581  1e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0686713  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3610  phage integrase family protein  67.22 
 
 
418 aa  584  1e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000842919  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0772  integrase family protein  66.75 
 
 
418 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.045428  normal  0.308658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1655  phage integrase family protein  57.04 
 
 
420 aa  505  1e-142  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0191595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4354  integrase family protein  33.67 
 
 
445 aa  198  2e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0248698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3889  phage integrase, putative  33.16 
 
 
432 aa  189  6e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000353876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2610  integrase family protein  30.57 
 
 
411 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2978  prophage LambdaSo, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.09 
 
 
399 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1555  phage integrase, putative  31.98 
 
 
423 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.206278  decreased coverage  4.7649e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0405  phage integrase family protein  30.6 
 
 
402 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.629501  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4126  phage integrase family protein  32.24 
 
 
432 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.727989  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.57 
 
 
415 aa  78.2  3e-13  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.2 
 
 
422 aa  77  6e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  26.98 
 
 
408 aa  69.7  1e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1581  hypothetical protein  32.26 
 
 
168 aa  66.6  8e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638214  normal  0.178566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  25.29 
 
 
415 aa  66.2  9e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  27.2 
 
 
409 aa  65.9  1e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  26.99 
 
 
413 aa  65.9  1e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25.67 
 
 
414 aa  65.5  2e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  23.57 
 
 
453 aa  64.3  4e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  21.37 
 
 
422 aa  63.2  8e-09  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  22.36 
 
 
433 aa  62.8  1e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3754  integrase family protein  27.05 
 
 
407 aa  62.4  1e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.290204  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  25.51 
 
 
416 aa  61.2  3e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  22.19 
 
 
395 aa  60.8  4e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  21.84 
 
 
422 aa  60.8  4e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.75 
 
 
361 aa  60.8  4e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1571  site-specific recombinase, phage integrase family  24.66 
 
 
409 aa  60.5  6e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0359454  decreased coverage  6.98249e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  22.27 
 
 
439 aa  60.5  6e-08  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  26.98 
 
 
414 aa  60.1  8e-08  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  23.61 
 
 
412 aa  59.7  9e-08  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  21.97 
 
 
439 aa  59.7  9e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  24.62 
 
 
416 aa  59.7  1e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  24.53 
 
 
410 aa  59.3  1e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1914  integrative genetic element Gsu32, integrase, putative  25.19 
 
 
433 aa  59.7  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.409637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  23.16 
 
 
413 aa  59.3  1e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  23.26 
 
 
410 aa  59.7  1e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0813  integrase family protein  26.67 
 
 
427 aa  58.5  2e-07  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.71518e-11 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  21.81 
 
 
419 aa  58.5  2e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  23.96 
 
 
400 aa  58.5  2e-07  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  9.71423e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  25.48 
 
 
418 aa  57.8  4e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1878  putative integrase  22.73 
 
 
425 aa  57  6e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.184819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  25 
 
 
419 aa  56.6  9e-07  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3239  integrase family protein  23.62 
 
 
424 aa  56.2  1e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0978515  normal  0.26506 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  23.75 
 
 
411 aa  56.2  1e-06  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  26.64 
 
 
290 aa  56.2  1e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0939  phage integrase family site specific recombinase  25.3 
 
 
406 aa  55.8  1e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.456123  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  24.51 
 
 
418 aa  55.1  2e-06  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  24.56 
 
 
413 aa  55.5  2e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2650  integrase family protein  25.94 
 
 
410 aa  55.1  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0205154  hitchhiker  3.95125e-06 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2626  phage integrase family protein  24.13 
 
 
393 aa  55.8  2e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000269871  normal  0.0831358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  23.1 
 
 
515 aa  55.5  2e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  27.65 
 
 
410 aa  54.7  3e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  25.1 
 
 
389 aa  54.7  3e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  22.71 
 
 
418 aa  54.7  3e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.45 
 
 
413 aa  55.1  3e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.83 
 
 
444 aa  54.3  4e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  22.58 
 
 
397 aa  53.5  6e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.88 
 
 
432 aa  53.9  6e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2292  phage integrase family protein  22.9 
 
 
393 aa  53.5  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.919949  normal  0.20238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.74 
 
 
418 aa  53.5  7e-06  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  22.38 
 
 
443 aa  53.1  8e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  23.81 
 
 
437 aa  53.1  9e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  21.15 
 
 
425 aa  53.1  9e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  24.24 
 
 
411 aa  52.8  1e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  21.72 
 
 
398 aa  52.4  1e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  27.11 
 
 
404 aa  52  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.99 
 
 
413 aa  52  2e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  28.91 
 
 
391 aa  52  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  24.05 
 
 
455 aa  52.4  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  25.12 
 
 
387 aa  52  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2942  phage integrase family protein  23.32 
 
 
392 aa  52  2e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  9.83731e-14 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 
394 aa  51.6  2e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  21.26 
 
 
419 aa  51.6  3e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  23.08 
 
 
409 aa  50.8  4e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  30.72 
 
 
404 aa  51.2  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  20.77 
 
 
420 aa  50.8  4e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  2.99734e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2015  phage integrase family site specific recombinase  26.81 
 
 
390 aa  50.8  4e-05  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  27.82 
 
 
367 aa  50.8  4e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  30.72 
 
 
404 aa  51.2  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  22.08 
 
 
420 aa  51.2  4e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  21.99 
 
 
413 aa  51.2  4e-05  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  30.72 
 
 
404 aa  50.8  4e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25.38 
 
 
446 aa  50.8  5e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.66 
 
 
417 aa  50.8  5e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  26.19 
 
 
395 aa  50.4  5e-05  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  21.71 
 
 
418 aa  50.4  6e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  22.14 
 
 
426 aa  50.1  7e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  22.22 
 
 
439 aa  50.1  7e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>