More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1927 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  99.54 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  100 
 
 
219 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  99.54 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  94.98 
 
 
219 aa  430  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  93.15 
 
 
219 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  93.15 
 
 
219 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  93.15 
 
 
219 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  91.78 
 
 
219 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  75.12 
 
 
219 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
220 aa  208  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.85 
 
 
218 aa  204  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 
220 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 
221 aa  196  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 
227 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 
223 aa  194  6e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1981  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 
222 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 
224 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 
223 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  47.2 
 
 
219 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 
220 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 
219 aa  189  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  43.52 
 
 
218 aa  188  5e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
220 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 
227 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 
239 aa  187  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 
220 aa  187  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 
222 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.58 
 
 
219 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.91 
 
 
218 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 
222 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 
219 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 
220 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  43.58 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.58 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  43.58 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.58 
 
 
219 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.58 
 
 
219 aa  185  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 
233 aa  185  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.58 
 
 
219 aa  185  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  43.52 
 
 
232 aa  184  9e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  45.45 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  43.06 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 
221 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
220 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4240  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 
220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 
220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.2 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 
227 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 
220 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4530  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.13 
 
 
219 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.13 
 
 
219 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.13 
 
 
219 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.13 
 
 
219 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.13 
 
 
219 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.59 
 
 
220 aa  178  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  44.04 
 
 
220 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.01 
 
 
219 aa  177  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 
220 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 
220 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 
283 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  42.13 
 
 
220 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  44.91 
 
 
241 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 
230 aa  175  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 
221 aa  175  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1358  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
222 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42964  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
220 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  42.59 
 
 
220 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3490  DNA-binding transcriptional regulator QseB  42.2 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  41.82 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0139  DNA-binding response regulator  42.13 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315235  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 
221 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  40.74 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2384  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 
222 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00270522  hitchhiker  0.0000210023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 
220 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  47.69 
 
 
225 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  47.69 
 
 
225 aa  169  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>