153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1616 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  100 
 
 
321 aa  663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  99.07 
 
 
321 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  97.2 
 
 
321 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  98.43 
 
 
319 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  91.59 
 
 
321 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  91.28 
 
 
321 aa  622  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  91.28 
 
 
321 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  91.83 
 
 
306 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  75.39 
 
 
321 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  76.92 
 
 
322 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  75.16 
 
 
319 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1213  decaheme cytochrome c MtrD  70.72 
 
 
318 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.766107  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  67.48 
 
 
333 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  67.48 
 
 
333 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  67.48 
 
 
333 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  67.17 
 
 
333 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  67.48 
 
 
333 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  67.17 
 
 
329 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  67.9 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  67.59 
 
 
329 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  66.87 
 
 
329 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  66.07 
 
 
333 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  66.07 
 
 
333 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  65.96 
 
 
329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  65.23 
 
 
326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  63.64 
 
 
334 aa  441  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  63.22 
 
 
328 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  59.87 
 
 
317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  60.51 
 
 
317 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  59.09 
 
 
316 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  58.23 
 
 
316 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  57.64 
 
 
318 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  59.93 
 
 
314 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  60.47 
 
 
316 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  58.44 
 
 
309 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  56.15 
 
 
315 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  59.55 
 
 
314 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  58.77 
 
 
315 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  57.05 
 
 
312 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  58.23 
 
 
304 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1305  cytochrome c family protein  59.93 
 
 
310 aa  325  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000952698 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  46.6 
 
 
326 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4360  decaheme cytochrome c  47.04 
 
 
304 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0361  decaheme cytochrome c MtrA  48.29 
 
 
286 aa  269  5e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162857  hitchhiker  0.000223849 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3859  cytochrome C family protein  47.28 
 
 
287 aa  267  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00158078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  40.42 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  41.97 
 
 
307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  40.07 
 
 
299 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  38.21 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2381  cytochrome C family protein  38.36 
 
 
315 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.300688  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  36.28 
 
 
540 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  35.46 
 
 
577 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  33.56 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  33.13 
 
 
334 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  32.23 
 
 
334 aa  158  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  29.91 
 
 
337 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  32.99 
 
 
335 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  30.15 
 
 
363 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  30.19 
 
 
307 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  28.46 
 
 
259 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  29.27 
 
 
658 aa  93.2  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  30.04 
 
 
658 aa  85.9  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.9 
 
 
480 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.77 
 
 
656 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  31.03 
 
 
646 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.76 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  30.57 
 
 
658 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.48 
 
 
650 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  27.41 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.68 
 
 
650 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3156  hypothetical protein  33.08 
 
 
154 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  30.53 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  27.67 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0253  hypothetical protein  38.35 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  30.37 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.1 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  29.33 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  29.02 
 
 
427 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3831  cytochrome C family protein  31.07 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3163  cytochrome C family protein  28 
 
 
442 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0616  cytochrome c family protein  27.53 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3764  formate-dependent nitrite reductase  30.46 
 
 
154 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0615  hypothetical protein  32.84 
 
 
154 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2902  hypothetical protein  27.69 
 
 
153 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  29.26 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3962  formate-dependent nitrite reductase  30.46 
 
 
154 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0518  hypothetical protein  33.6 
 
 
156 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3837  formate-dependent nitrite reductase  30.46 
 
 
154 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4530  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.28 
 
 
188 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0240  formate-dependent nitrite reductase  29.69 
 
 
157 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4623  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.28 
 
 
188 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4621  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.28 
 
 
188 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342396 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2734  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  34.81 
 
 
189 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4672  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.28 
 
 
188 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4537  cytochrome c nitrite reductase pentaheme subunit  29.28 
 
 
188 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  28.72 
 
 
436 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.72 
 
 
436 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03943  nitrite reductase, formate-dependent, penta-heme cytochrome c  36.55 
 
 
188 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3921  cytochrome c nitrite reductase, pentaheme subunit  36.55 
 
 
188 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  29.08 
 
 
436 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>