16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1557 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1557  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  775  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.71793  normal  0.744672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4272  hypothetical protein  34.44 
 
 
494 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0626  hypothetical protein  35.55 
 
 
496 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.339165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2247  hypothetical protein  23.65 
 
 
351 aa  65.5  1e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0221493  normal  0.0124009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0025  hypothetical protein  23.18 
 
 
603 aa  50.4  5e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0033  hypothetical protein  23.18 
 
 
603 aa  50.4  5e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6364  hypothetical protein  23.33 
 
 
606 aa  50.1  7e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.038941  normal  0.601528 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0867  hypothetical protein  28.49 
 
 
451 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3327  hypothetical protein  20.32 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000506493  hitchhiker  9.65434e-22 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2265  hypothetical protein  24.07 
 
 
540 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730456  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4364  hypothetical protein  20.56 
 
 
484 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.945805  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1992  hypothetical protein  26.09 
 
 
518 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4173  hypothetical protein  29.82 
 
 
479 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0983315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3859  hypothetical protein  24.59 
 
 
734 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6326  hypothetical protein  27.78 
 
 
1267 aa  43.5  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0236689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4438  hypothetical protein  25.48 
 
 
476 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.35414  normal  0.628211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>