More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1316 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  43.64 
 
 		 1329 aa  989    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  41.46 
 
 		 998 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  52.97 
 
 		 1429 aa  1550    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.59 
 
 		 1035 aa  807    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  99.93 
 
 		 1440 aa  2968    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  53.28 
 
 		 1432 aa  1546    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.76 
 
 		 1124 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  54.54 
 
 		 1450 aa  1618    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.78 
 
 		 1117 aa  718    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.37 
 
 		 1025 aa  638    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  69.53 
 
 		 1441 aa  2084    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 1440 aa  2969    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  51.54 
 
 		 1472 aa  1492    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  43.1 
 
 		 1328 aa  964    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.64 
 
 		 1176 aa  632  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.22 
 
 		 1331 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.15 
 
 		 891 aa  605  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  36.99 
 
 		 1942 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.77 
 
 		 2156 aa  599  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.56 
 
 		 946 aa  589  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  44.02 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  36.94 
 
 		 991 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.28 
 
 		 1891 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.79 
 
 		 1975 aa  555  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  38.49 
 
 		 1062 aa  550  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.72 
 
 		 1248 aa  525  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35 
 
 		 1855 aa  516  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.39 
 
 		 2068 aa  502  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  29.37 
 
 		 1136 aa  296  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  30.4 
 
 		 850 aa  281  7e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.4 
 
 		 852 aa  281  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.23 
 
 		 852 aa  277  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  29.99 
 
 		 852 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  29.99 
 
 		 852 aa  276  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.24 
 
 		 1043 aa  267  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.41 
 
 		 655 aa  258  5e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  27.46 
 
 		 655 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.59 
 
 		 1888 aa  244  7e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  32.48 
 
 		 718 aa  239  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  29.76 
 
 		 1064 aa  233  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.98 
 
 		 2638 aa  232  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  31.16 
 
 		 825 aa  232  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.11 
 
 		 899 aa  232  5e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  27.22 
 
 		 1064 aa  232  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.85 
 
 		 841 aa  231  6e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  27.85 
 
 		 874 aa  231  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  29.83 
 
 		 647 aa  228  8e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  33.99 
 
 		 856 aa  211  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  28.55 
 
 		 928 aa  211  9e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  37.08 
 
 		 852 aa  207  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  36.78 
 
 		 852 aa  206  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  26.83 
 
 		 601 aa  205  7e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.13 
 
 		 669 aa  204  9e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  36.97 
 
 		 848 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.72 
 
 		 713 aa  202  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  36.17 
 
 		 848 aa  202  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.72 
 
 		 713 aa  202  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  26.31 
 
 		 713 aa  201  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.31 
 
 		 713 aa  201  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  26.31 
 
 		 713 aa  200  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  30.74 
 
 		 843 aa  199  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.69 
 
 		 713 aa  198  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  26.82 
 
 		 713 aa  197  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.39 
 
 		 713 aa  197  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  26.86 
 
 		 713 aa  196  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  28.34 
 
 		 842 aa  195  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  29.48 
 
 		 843 aa  190  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.42 
 
 		 713 aa  190  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  29.48 
 
 		 640 aa  179  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.38 
 
 		 1252 aa  172  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  31.1 
 
 		 712 aa  164  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  31.86 
 
 		 766 aa  161  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  23.26 
 
 		 776 aa  155  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  28.65 
 
 		 640 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  30.03 
 
 		 817 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  29.54 
 
 		 701 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1082  hypothetical protein  66.18 
 
 		 91 aa  101  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.616651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  24.18 
 
 		 706 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  24.19 
 
 		 771 aa  97.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  22.81 
 
 		 729 aa  97.1  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  22.69 
 
 		 711 aa  97.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  26.92 
 
 		 750 aa  96.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  27.66 
 
 		 774 aa  96.3  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  22.4 
 
 		 711 aa  96.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  23.38 
 
 		 743 aa  95.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3089  glycogen debranching enzyme GlgX  28.54 
 
 		 734 aa  95.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000640633  hitchhiker  0.0000151217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  22.4 
 
 		 711 aa  95.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  25.53 
 
 		 677 aa  95.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  24.4 
 
 		 700 aa  95.5  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  22.91 
 
 		 709 aa  95.5  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  23.64 
 
 		 721 aa  95.1  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  25.99 
 
 		 708 aa  94.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  27.32 
 
 		 702 aa  94.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  27.4 
 
 		 802 aa  93.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  26.26 
 
 		 707 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  23.73 
 
 		 697 aa  93.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  25.59 
 
 		 718 aa  94  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  23.45 
 
 		 695 aa  94.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  24.7 
 
 		 701 aa  93.2  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  26.65 
 
 		 752 aa  93.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>