More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1246 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  61.4 
 
 
512 aa  644  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  98.08 
 
 
468 aa  957  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  99.15 
 
 
468 aa  964  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  65.89 
 
 
470 aa  650  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  88.03 
 
 
482 aa  865  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  88.89 
 
 
491 aa  874  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.101e-05  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  89.1 
 
 
466 aa  875  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  5.32238e-08  hitchhiker  7.91404e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  89.53 
 
 
466 aa  881  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.44164e-07  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  99.36 
 
 
468 aa  965  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  100 
 
 
468 aa  969  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  91.24 
 
 
468 aa  900  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  65.39 
 
 
472 aa  636  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  62.3 
 
 
491 aa  617  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  61.93 
 
 
475 aa  613  1e-174  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  63.79 
 
 
475 aa  611  1e-174  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  65.95 
 
 
462 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  44.59 
 
 
441 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  44.52 
 
 
439 aa  416  1e-115  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  44.66 
 
 
433 aa  400  1e-110  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.24474e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  41.91 
 
 
498 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  43.56 
 
 
429 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  49.72 
 
 
436 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  50.85 
 
 
353 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.85495e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  39.74 
 
 
460 aa  345  9e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  37.72 
 
 
447 aa  308  2e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  1.56584e-05  decreased coverage  1.18926e-09 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  34.53 
 
 
470 aa  308  2e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  37.42 
 
 
468 aa  306  4e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.24 
 
 
517 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  2.97595e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  41.84 
 
 
503 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  1.86305e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  37.61 
 
 
475 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  37.66 
 
 
475 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  1.03245e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.74 
 
 
474 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  41.01 
 
 
479 aa  293  5e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  36.54 
 
 
473 aa  287  3e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  4.94323e-08  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.31 
 
 
459 aa  285  1e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  35.89 
 
 
472 aa  283  4e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.82967e-07  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.93 
 
 
473 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.93 
 
 
475 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.03 
 
 
513 aa  276  4e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.56 
 
 
480 aa  269  9e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.33 
 
 
490 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  39.03 
 
 
741 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.24744e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.49 
 
 
490 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.83 
 
 
448 aa  249  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  7.36446e-08  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  35.38 
 
 
477 aa  236  5e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  35.38 
 
 
477 aa  235  1e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  35.63 
 
 
471 aa  234  4e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.57 
 
 
503 aa  233  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  35.42 
 
 
439 aa  233  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  31.53 
 
 
438 aa  233  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.92356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  31.53 
 
 
438 aa  233  7e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.48125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.34 
 
 
471 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  33.42 
 
 
430 aa  231  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  31.57 
 
 
446 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  30.29 
 
 
441 aa  226  5e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  1.1239e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  32.99 
 
 
410 aa  226  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.44361e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.3 
 
 
472 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  29.84 
 
 
440 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  34.04 
 
 
424 aa  222  1e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  34.94 
 
 
441 aa  222  1e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  35.36 
 
 
430 aa  222  1e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  34.38 
 
 
423 aa  221  2e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  29.55 
 
 
470 aa  220  4e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  34.12 
 
 
443 aa  219  6e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  33.59 
 
 
418 aa  214  2e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.31 
 
 
441 aa  215  2e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  29.82 
 
 
439 aa  215  2e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.32327e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  29.78 
 
 
440 aa  214  3e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.02583e-05  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  34.67 
 
 
438 aa  214  4e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  33.97 
 
 
418 aa  213  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  3.41195e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
419 aa  212  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  31.86 
 
 
452 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  34.25 
 
 
431 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  3.8042e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  29.61 
 
 
439 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  29.61 
 
 
439 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  34.66 
 
 
431 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  2.00771e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  34.66 
 
 
431 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  6.65253e-10 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.37786e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.91864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  31.86 
 
 
423 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.81632e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.97391e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.17074e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  30.42 
 
 
440 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  29.9 
 
 
486 aa  209  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  2.8881e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  29.39 
 
 
439 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  29.39 
 
 
439 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  29.39 
 
 
439 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.47 
 
 
438 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  34.43 
 
 
465 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  33.33 
 
 
419 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  33.63 
 
 
417 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  34.23 
 
 
434 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  33.93 
 
 
433 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  33.93 
 
 
433 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  32.23 
 
 
457 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  33.93 
 
 
433 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.35092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  33.93 
 
 
433 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  8.22209e-05 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>