88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0867 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  54.52 
 
 
865 aa  889    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  74 
 
 
887 aa  1256    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  72.84 
 
 
897 aa  1220    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  74.23 
 
 
887 aa  1255    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  74.49 
 
 
889 aa  1230    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  97.3 
 
 
884 aa  1703    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  96.06 
 
 
879 aa  1682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  51.27 
 
 
850 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  79.82 
 
 
878 aa  1332    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  53.06 
 
 
840 aa  810    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  100 
 
 
889 aa  1782    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  55.96 
 
 
845 aa  848    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  51.22 
 
 
849 aa  775    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  95.28 
 
 
889 aa  1680    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  41.8 
 
 
836 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  42.38 
 
 
836 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  43.48 
 
 
872 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.22 
 
 
817 aa  303  8.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  28.4 
 
 
817 aa  285  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.61 
 
 
817 aa  280  9e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.72 
 
 
836 aa  262  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  28.51 
 
 
820 aa  243  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.99 
 
 
825 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.97 
 
 
819 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  30.19 
 
 
826 aa  220  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.96 
 
 
850 aa  215  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  30.82 
 
 
819 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  30.3 
 
 
819 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  27.55 
 
 
800 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 
821 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.86 
 
 
804 aa  205  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  28.31 
 
 
849 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.29 
 
 
821 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.64 
 
 
815 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  28.45 
 
 
820 aa  194  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
847 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.22 
 
 
821 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  25.96 
 
 
803 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.25 
 
 
800 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  24.66 
 
 
813 aa  182  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.12 
 
 
855 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 
847 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.11 
 
 
802 aa  179  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.18 
 
 
870 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.68 
 
 
793 aa  175  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  26.64 
 
 
821 aa  174  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  26.27 
 
 
866 aa  171  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.89 
 
 
837 aa  150  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  24.71 
 
 
929 aa  132  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 
845 aa  125  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.24 
 
 
843 aa  125  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  30.63 
 
 
819 aa  121  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  32.24 
 
 
820 aa  112  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.34 
 
 
858 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 
846 aa  105  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.74 
 
 
839 aa  99.4  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  21.17 
 
 
857 aa  91.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.63 
 
 
851 aa  89.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 
849 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.57 
 
 
795 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.49 
 
 
858 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  27.51 
 
 
843 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  22.9 
 
 
867 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  24.63 
 
 
842 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  25.63 
 
 
753 aa  77  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
842 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
842 aa  76.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 
849 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  22.53 
 
 
846 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  25.3 
 
 
841 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  22.11 
 
 
850 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  29.57 
 
 
795 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 
884 aa  66.6  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.57 
 
 
795 aa  65.5  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  22.34 
 
 
868 aa  65.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  21.39 
 
 
855 aa  63.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 
857 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  22.89 
 
 
855 aa  59.3  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  22.42 
 
 
855 aa  57.8  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  19.45 
 
 
853 aa  56.2  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.05 
 
 
835 aa  54.7  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 
835 aa  54.7  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  24.16 
 
 
877 aa  52.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  24.53 
 
 
877 aa  50.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  19.13 
 
 
408 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  20.85 
 
 
856 aa  47  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  21.5 
 
 
848 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.04 
 
 
841 aa  46.2  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>