More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0567 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  99.52 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  99.04 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  99.04 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  89.42 
 
 		 208 aa  394  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4048  cytochrome c family protein  82.21 
 
 		 208 aa  350  5.9999999999999994e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  81.34 
 
 		 208 aa  349  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  81.34 
 
 		 208 aa  347  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3432  cytochrome c family protein  80.38 
 
 		 208 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.402335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  65.02 
 
 		 204 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  62.71 
 
 		 199 aa  244  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3546  cytochrome c family protein  57.5 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  45.25 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  41.55 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1310  diheme-containing protein c4  40.98 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0194  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 220 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  40.58 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  40.58 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  40.58 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1477  cytochrome c class I  40.33 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.911342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  40.34 
 
 		 262 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  41.14 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  40.23 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  36.24 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  41.14 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  41.11 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0409  cytochrome c, class I  42.68 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  39.04 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  35.83 
 
 		 237 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  40.56 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  39.66 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.91 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  33.03 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  35.91 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.41 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  34.41 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.41 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.41 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  38.98 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.67 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  33.15 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  38.2 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  35.67 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  34.07 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.55 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  34.03 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  37.93 
 
 		 205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.05 
 
 		 318 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  32.08 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  36.78 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4605  cytochrome c, class I  42.07 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0013993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  38.64 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  31.95 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  32.57 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  35.47 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  33.94 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  35.39 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  33.94 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  32.71 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  33.98 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  33.14 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  33.98 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  34.3 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  34.64 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3894  cytochrome c553-like protein  36.05 
 
 		 271 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  36.21 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  33.14 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  32.97 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  36.02 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  33.82 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2721  cytochrome c, class I  37.08 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  34.66 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2593  cytochrome c, class I  37.08 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.412189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4079  putative cytochrome c, class I  35.63 
 
 		 269 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  34.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  31.13 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  33.15 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  31.92 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2705  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000103804  unclonable  0.0000000000307641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  34.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3107  cytochrome c4  37.5 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0350454  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  32.86 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  34.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  35.8 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  38.04 
 
 		 265 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2599  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3714  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1956  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  34.86 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  32.86 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3510  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 206 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>