122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0482 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  543  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0485  hypothetical protein  96.9 
 
 		 257 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0461  hypothetical protein  95.74 
 
 		 257 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3858  hypothetical protein  95.28 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0537  hypothetical protein  78.21 
 
 		 263 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1924  hypothetical protein  32.29 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0117  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.04 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1802  extracellular solute-binding protein  22.84 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202097  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3796  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.814508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.85 
 
 		 2654 aa  72  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05910  putative periplasmic transport system  25.35 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.760752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0556  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0486  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0051  extracellular solute-binding protein family 3  21.82 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5028  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2960  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.374689  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0260  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.26 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.906193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 		 1279 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1339  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1329  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3019  extracellular solute-binding protein family 3  23.81 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11740  hypothetical protein  27.63 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.22588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4852  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157097  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3734  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5004  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.828614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4955  hypothetical protein  22.86 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5282  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4828  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1365  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.975535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4979  periplasmic binding protein, putative  28.57 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2202  amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.53 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0325  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1256  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.74 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5010  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.12 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.84 
 
 		 1322 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5251  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0510  extracellular solute-binding protein  20.24 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0513  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1077  hypothetical protein  25.83 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2177  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0443241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3729  periplasmic amino acid-binding protein-related protein  22.9 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0477  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1080  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.950195  normal  0.541205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.85 
 
 		 502 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.85 
 
 		 502 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 269 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2926  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.441987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3063  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.57 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.898818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2034  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2828  extracellular solute-binding protein  20.93 
 
 		 258 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2131  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0687  extracellular solute-binding protein  20.33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1579  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 618 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4079  extracellular solute-binding protein family 3  24.49 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.711512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1185  extracellular solute-binding protein family 3  23.63 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0387  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2079  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2750  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.47 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3188  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.66 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1026  amino acid ABC transporter  28.83 
 
 		 270 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0421  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2337  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 258 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329158  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 279 aa  49.3  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0247  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000342463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2470  solute-binding family 1 protein  25.62 
 
 		 245 aa  48.9  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.162983  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2474  solute-binding family 1 protein  23.85 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 252 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1583  ABC transporter periplasmic-binding protein  23.33 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0436102  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3508  amino acid ABC transporter  23.51 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2767  extracellular solute-binding protein family 3  22.22 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  20.35 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2454  extracellular solute-binding protein family 3  21.83 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1503  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.95 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1231  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000126239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3070  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 286 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  22.9 
 
 		 244 aa  46.2  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 270 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1052  amino acid ABC transporter  27.78 
 
 		 303 aa  46.2  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1707  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 483 aa  46.6  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  24.29 
 
 		 263 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3830  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 248 aa  46.2  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000366277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4217  ABC type amino acid transport system periplasmic component protein  22.61 
 
 		 265 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.65 
 
 		 266 aa  45.4  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2080  diguanylate cyclase  25.85 
 
 		 934 aa  45.4  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0117  extracellular solute-binding protein family 3  21 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1508  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118262  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1275  extracellular solute-binding protein  21.89 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  22.12 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  22.27 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3251  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  21.4 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1645  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 		 615 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1070  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000162274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1074  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3082  extracellular solute-binding protein family 3  21.61 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00109919  hitchhiker  0.00184496 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2573  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000612077  hitchhiker  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1308  extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178396  normal  0.999326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>