More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0399 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  73 
 
 
466 aa  705    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  73.22 
 
 
466 aa  709    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  73.22 
 
 
466 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  73.38 
 
 
466 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  97.85 
 
 
474 aa  930    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4210  isopropylmalate isomerase large subunit  69.18 
 
 
471 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  93.1 
 
 
474 aa  884    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  73 
 
 
466 aa  705    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  72.51 
 
 
466 aa  695    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  72.94 
 
 
466 aa  702    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  72.47 
 
 
476 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  99.36 
 
 
468 aa  961    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3797  isopropylmalate isomerase large subunit  71.86 
 
 
466 aa  692    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2067  isopropylmalate isomerase large subunit  72.32 
 
 
467 aa  686    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0388  isopropylmalate isomerase large subunit  98.93 
 
 
468 aa  958    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  72.29 
 
 
466 aa  691    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  73.22 
 
 
466 aa  709    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3826  isopropylmalate isomerase large subunit  87.53 
 
 
466 aa  841    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  72.73 
 
 
466 aa  692    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3609  isopropylmalate isomerase large subunit  71.21 
 
 
466 aa  686    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0375  isopropylmalate isomerase large subunit  71.61 
 
 
471 aa  699    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0399  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 
468 aa  965    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573464 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  73 
 
 
466 aa  708    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  73.38 
 
 
466 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0395  isopropylmalate isomerase large subunit  87.1 
 
 
466 aa  830    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0336  isopropylmalate isomerase large subunit  87.1 
 
 
482 aa  838    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  73 
 
 
466 aa  708    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03087  isopropylmalate isomerase large subunit  67.75 
 
 
466 aa  645    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0387  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 
468 aa  965    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4548  isopropylmalate isomerase large subunit  86.18 
 
 
466 aa  819    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.182173  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  72.47 
 
 
476 aa  700    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0390  isopropylmalate isomerase large subunit  70.78 
 
 
469 aa  666    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  94.22 
 
 
474 aa  896    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0370  isopropylmalate isomerase large subunit  94.59 
 
 
474 aa  890    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3818  isopropylmalate isomerase large subunit  89.22 
 
 
470 aa  846    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  73.38 
 
 
466 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  73.22 
 
 
466 aa  709    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3470  isopropylmalate isomerase large subunit  89.03 
 
 
466 aa  848    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  0.406012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  73.22 
 
 
466 aa  709    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  94.4 
 
 
474 aa  894    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  73.38 
 
 
466 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  73.38 
 
 
466 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0337  isopropylmalate isomerase large subunit  87.45 
 
 
470 aa  820    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.301995  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  72.79 
 
 
466 aa  700    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  72.73 
 
 
466 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  72.47 
 
 
476 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3567  isopropylmalate isomerase large subunit  65.09 
 
 
477 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  63.71 
 
 
472 aa  625  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3270  isopropylmalate isomerase large subunit  66.96 
 
 
468 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.72 
 
 
469 aa  618  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  66.45 
 
 
468 aa  619  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.17 
 
 
473 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1779  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.67 
 
 
467 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  64.59 
 
 
468 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  64.59 
 
 
468 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  64.03 
 
 
469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  63.73 
 
 
469 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  65.23 
 
 
467 aa  600  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  64.66 
 
 
470 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  63.73 
 
 
469 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  61.37 
 
 
470 aa  598  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  64.03 
 
 
469 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  64.36 
 
 
470 aa  595  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  63.44 
 
 
468 aa  597  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  63.81 
 
 
469 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  63.81 
 
 
469 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  60.39 
 
 
471 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  63.26 
 
 
469 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  64.03 
 
 
480 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1887  isopropylmalate isomerase large subunit  59.4 
 
 
468 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.574068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  63.6 
 
 
469 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  62.88 
 
 
469 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  62.88 
 
 
469 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  63.17 
 
 
470 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 
469 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 
469 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  62.82 
 
 
470 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2094  isopropylmalate isomerase large subunit  59.4 
 
 
468 aa  592  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 
469 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  63.3 
 
 
477 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  63.68 
 
 
470 aa  594  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  63.09 
 
 
469 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  63.38 
 
 
469 aa  589  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  62.94 
 
 
465 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  63.3 
 
 
469 aa  589  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
479 aa  588  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  61.04 
 
 
471 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
469 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
469 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0015  isopropylmalate isomerase large subunit  59.18 
 
 
468 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
469 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
469 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  62.66 
 
 
469 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  62.88 
 
 
469 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  62.77 
 
 
473 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  61.99 
 
 
467 aa  591  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  63.44 
 
 
469 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  62.45 
 
 
469 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  63.28 
 
 
470 aa  589  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  62.96 
 
 
472 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>