More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0371 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  100 
 
 		 989 aa  2035    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  47.75 
 
 		 997 aa  919    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  36.66 
 
 		 971 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  26.93 
 
 		 994 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  26.58 
 
 		 987 aa  266  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  27.06 
 
 		 722 aa  115  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  36.77 
 
 		 674 aa  93.2  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  36.14 
 
 		 756 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  35.66 
 
 		 771 aa  81.6  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  34 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  35.97 
 
 		 774 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  34.04 
 
 		 738 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  34.51 
 
 		 774 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  31.52 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  31.76 
 
 		 723 aa  70.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  22.71 
 
 		 784 aa  68.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  24.7 
 
 		 783 aa  67.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  22.67 
 
 		 796 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  29.93 
 
 		 719 aa  65.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 933 aa  62  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  21.21 
 
 		 452 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  26.86 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  20.41 
 
 		 363 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2874  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 693 aa  56.6  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  31.03 
 
 		 240 aa  57  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 652 aa  57.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 741 aa  56.6  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 445 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  34.75 
 
 		 946 aa  56.2  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.46 
 
 		 1822 aa  55.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  31.19 
 
 		 367 aa  55.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 839 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 704 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  28.57 
 
 		 567 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 		 513 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  25.1 
 
 		 746 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  30.33 
 
 		 609 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 1061 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 455 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 		 683 aa  53.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 524 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1828  sensor histidine kinase  27.06 
 
 		 674 aa  53.5  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.719935  normal  0.143927 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  31.3 
 
 		 673 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.26 
 
 		 1255 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 930 aa  53.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.346474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  31 
 
 		 464 aa  52.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  26.07 
 
 		 519 aa  52.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 		 801 aa  52.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  25.63 
 
 		 1379 aa  52.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 835 aa  52.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 879 aa  52  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.32 
 
 		 963 aa  52  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 885 aa  52  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 879 aa  52  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 835 aa  52.4  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2215  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 810 aa  52  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 		 578 aa  52  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 885 aa  52  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 676 aa  52  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1211 aa  52.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 835 aa  52.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3029  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.83 
 
 		 461 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.39 
 
 		 640 aa  52.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0402  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 398 aa  52  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93747  normal  0.145713 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3917  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 710 aa  52  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0985  histidine kinase  29.25 
 
 		 394 aa  51.6  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 838 aa  51.6  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 457 aa  51.6  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  26.09 
 
 		 684 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 519 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  32.41 
 
 		 651 aa  51.2  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1474  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 894 aa  51.2  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3217  two-component sensor histidine kinase  25.68 
 
 		 725 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  31.58 
 
 		 662 aa  51.2  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 838 aa  50.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  26.6 
 
 		 587 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  26.72 
 
 		 594 aa  50.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  32.46 
 
 		 846 aa  50.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 434 aa  50.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 456 aa  50.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  27.68 
 
 		 420 aa  51.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 480 aa  50.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 441 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4054  ATPase domain-containing protein  22.1 
 
 		 1756 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.892687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3091  sensor histidine kinase  32.69 
 
 		 444 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  27.71 
 
 		 530 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 733 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2121  histidine kinase  27.27 
 
 		 420 aa  51.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 961 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  26.24 
 
 		 665 aa  50.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 		 407 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 368 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  27.18 
 
 		 773 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  32.08 
 
 		 361 aa  50.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 683 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 587 aa  50.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.5 
 
 		 362 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 838 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  25 
 
 		 1020 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0428099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>