26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0300 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0300  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00679932  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0292  hypothetical protein  91.04 
 
 
86 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000163282  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0304  hypothetical protein  91.04 
 
 
83 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000261079  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0299  hypothetical protein  81.82 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000880989  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000079  hypothetical protein  52.46 
 
 
63 aa  57.4  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.231186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0402  hypothetical protein  74.07 
 
 
54 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000918691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1408  hypothetical protein  68.29 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2863  hypothetical protein  63.83 
 
 
59 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.327982 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05692  hypothetical protein  72.22 
 
 
62 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0117  hypothetical protein  57.69 
 
 
53 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4421  hypothetical protein  67.21 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2391  hypothetical protein  57.69 
 
 
54 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.595265  hitchhiker  0.00196894 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2885  hypothetical protein  70.73 
 
 
64 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4779  hypothetical protein  80.95 
 
 
49 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.151068  unclonable  0.00000000788092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2580  hypothetical protein  61.7 
 
 
51 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0287  hypothetical protein  88.89 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000239094  hitchhiker  0.000000000863491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3136  hypothetical protein  59.57 
 
 
51 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3277  hypothetical protein  59.57 
 
 
51 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.878206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1538  hypothetical protein  69.44 
 
 
53 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.038639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0095  hypothetical protein  60.61 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0112  hypothetical protein  80.49 
 
 
60 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3732  hypothetical protein  87.88 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00346538  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4387  hypothetical protein  78.57 
 
 
52 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0287  hypothetical protein  84.85 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000322851  decreased coverage  0.00000000141072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0102  hypothetical protein  87.88 
 
 
51 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119383  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0777  hypothetical protein  45.31 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>