44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0146 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0152  carboxypeptidase  88.24 
 
 
627 aa  1133    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  98.54 
 
 
683 aa  1389    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4754  peptidase M14 carboxypeptidase A  71.43 
 
 
627 aa  912    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0297814  unclonable  0.000000035744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
683 aa  1406    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0137  peptidase M14 carboxypeptidase A  71.91 
 
 
612 aa  924    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000376748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4365  carboxypeptidase  74.83 
 
 
615 aa  929    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  98.98 
 
 
683 aa  1394    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0143  peptidase M14, carboxypeptidase A  82.56 
 
 
663 aa  1160    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0033  peptidase M14, carboxypeptidase A  72.18 
 
 
613 aa  905    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  97.37 
 
 
684 aa  1352    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0161  carboxypeptidase  71.18 
 
 
610 aa  883    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.02 
 
 
659 aa  1155    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0100  peptidase M14, carboxypeptidase A  68.55 
 
 
619 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.719782  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0140  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.02 
 
 
665 aa  1147    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0145  peptidase M14, carboxypeptidase A  83.16 
 
 
658 aa  1149    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.666966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0192  peptidase M14 carboxypeptidase A  51.3 
 
 
631 aa  595  1e-168  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4531  peptidase M14 carboxypeptidase A  47.95 
 
 
609 aa  533  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.417367 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2083  peptidase M14, carboxypeptidase A  40.16 
 
 
634 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24600  putative carboxypeptidase  40.41 
 
 
634 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00674  zinc carboxypeptidase family  36.25 
 
 
592 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.76775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0129  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.99 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0118  peptidase M14 carboxypeptidase A  33.51 
 
 
581 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0111  peptidase M14, carboxypeptidase A  33.93 
 
 
581 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0115  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.03 
 
 
580 aa  303  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.231246  normal  0.11459 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07966  hypothetical protein  29.77 
 
 
570 aa  267  5.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.684592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5095  peptidase, family M14  29.08 
 
 
576 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000522149  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2367  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.33 
 
 
580 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.639683  normal  0.513126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6842  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.2 
 
 
577 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.922108  normal  0.679276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2612  hypothetical protein  28.24 
 
 
575 aa  235  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1907  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.4 
 
 
526 aa  185  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.327563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2049  peptidase, family M14  25.66 
 
 
484 aa  147  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.270897  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1797  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.16 
 
 
618 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.89 
 
 
599 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  22.45 
 
 
606 aa  89.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.45 
 
 
606 aa  89.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2152  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.44 
 
 
615 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07121  conserved hypothetical protein  21.39 
 
 
541 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.476588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4756  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.29 
 
 
506 aa  84.3  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2901  peptidase M14, carboxypeptidase A  21.49 
 
 
585 aa  63.9  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.55349  normal  0.0629312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.71 
 
 
557 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2078  hypothetical protein  25.13 
 
 
840 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.548714 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1110  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.64 
 
 
862 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.284775  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.03 
 
 
375 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3379  hypothetical protein  21.63 
 
 
906 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520045  normal  0.777695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>