38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0093 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0088  hypothetical protein  97.63 
 
 
337 aa  677  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4262  hypothetical protein  97.33 
 
 
337 aa  676  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0093  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  693  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0091  hypothetical protein  92.88 
 
 
337 aa  648  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0087  hypothetical protein  92.88 
 
 
337 aa  646  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0090  hypothetical protein  97.33 
 
 
337 aa  676  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0092  hypothetical protein  92.58 
 
 
337 aa  647  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2740  hypothetical protein  40.65 
 
 
337 aa  259  5e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.25522e-07  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1519  hypothetical protein  39.35 
 
 
338 aa  235  6e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.323363  normal  0.955579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3556  hypothetical protein  37.17 
 
 
332 aa  218  9e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.56461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4245  hypothetical protein  29.61 
 
 
345 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4055  hypothetical protein  30.38 
 
 
340 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4206  hypothetical protein  28.36 
 
 
345 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0138  hypothetical protein  29.48 
 
 
336 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3561  hypothetical protein  30.34 
 
 
338 aa  137  3e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0158  hypothetical protein  28.83 
 
 
336 aa  136  6e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4661  hypothetical protein  29.22 
 
 
345 aa  136  6e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4379  hypothetical protein  28.92 
 
 
345 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3831  hypothetical protein  29.04 
 
 
342 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.634724 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3924  hypothetical protein  29.04 
 
 
342 aa  129  7e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4040  hypothetical protein  28.74 
 
 
342 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3651  hypothetical protein  33.04 
 
 
336 aa  116  4e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1927  hypothetical protein  29.85 
 
 
323 aa  106  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.815512  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1570  hypothetical protein  31.84 
 
 
364 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.315068  normal  0.277616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2814  hypothetical protein  31.84 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1542  hypothetical protein  31.39 
 
 
364 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2556  hypothetical protein  32.29 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.209543  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21011  Galanin  25.84 
 
 
329 aa  80.1  5e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2125  hypothetical protein  32.05 
 
 
318 aa  79.3  8e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0635  hydrogenase expression/formation protein  27.13 
 
 
367 aa  73.9  3e-12  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0636  hypothetical protein  29.56 
 
 
373 aa  71.2  2e-11  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1703  hypothetical protein  25.22 
 
 
296 aa  70.9  3e-11  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1883  hypothetical protein  24.9 
 
 
523 aa  64.3  3e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1736  putative Galanin  28.57 
 
 
315 aa  63.9  4e-09  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.432742  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1737  hypothetical protein  24.73 
 
 
346 aa  61.6  2e-08  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2285  putative galanin  24.49 
 
 
321 aa  58.9  1e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1735  hypothetical protein  23.86 
 
 
330 aa  58.2  2e-07  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.6897  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0874  hypothetical protein  27.69 
 
 
324 aa  55.8  1e-06  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.256496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>