56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0085 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  96.55 
 
 
87 aa  177  3e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  95.4 
 
 
87 aa  177  6e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  94.32 
 
 
88 aa  176  7e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  81.61 
 
 
87 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  78.41 
 
 
88 aa  153  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  79.31 
 
 
87 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  79.31 
 
 
87 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  63.64 
 
 
108 aa  113  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  64.47 
 
 
82 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  55.7 
 
 
85 aa  103  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  59.74 
 
 
79 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  53.16 
 
 
81 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  53.49 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  38.75 
 
 
94 aa  70.5  8e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  3.05824e-05  hitchhiker  1.31346e-13 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  42.5 
 
 
99 aa  70.1  1e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  37.97 
 
 
90 aa  67.4  6e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  67  9e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  1.80646e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  4.10313e-05  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  3.0181e-09  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  1.55918e-05  hitchhiker  4.06701e-13 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  37.04 
 
 
94 aa  65.5  2e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  38.75 
 
 
93 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  7.05286e-09  hitchhiker  4.88804e-15 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  38.75 
 
 
143 aa  65.9  2e-10  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  5.26442e-05  hitchhiker  3.74352e-05 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  37.04 
 
 
161 aa  65.5  3e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  38.75 
 
 
115 aa  65.5  3e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  5.7579e-10  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  35.53 
 
 
100 aa  63.9  7e-10  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  36.25 
 
 
90 aa  61.2  4e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  6.70372e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
93 aa  61.6  4e-09  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  57.8  5e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  32.88 
 
 
95 aa  52.8  2e-06  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  25.88 
 
 
97 aa  51.6  3e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  34.18 
 
 
97 aa  51.2  4e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  26.58 
 
 
97 aa  48.9  3e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  28.57 
 
 
110 aa  48.1  4e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  48.1  4e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  32.91 
 
 
97 aa  48.1  4e-05  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  27.16 
 
 
96 aa  47.8  5e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  32.91 
 
 
98 aa  47.8  5e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  29.11 
 
 
104 aa  47.4  7e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  34.72 
 
 
93 aa  47.4  7e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  29.41 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  31.58 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  27.27 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  24.05 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2302  acetyltransferase-like protein  27.47 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  3.67089e-05  hitchhiker  0.00188481 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  30.38 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  27.85 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.98856e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  30.43 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3266  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.709169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  30.77 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  30 
 
 
114 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001234  predicted acetyltransferase  26.92 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546036  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  26.92 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  31.08 
 
 
92 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  29.27 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>