More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0075 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  99.18 
 
 
244 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  99.59 
 
 
244 aa  494  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  99.18 
 
 
244 aa  491  1e-138  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  97.54 
 
 
244 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  93.44 
 
 
244 aa  467  1e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  93.44 
 
 
244 aa  467  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  93.85 
 
 
244 aa  469  1e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  93.44 
 
 
244 aa  466  1e-130  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.73343e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  84.02 
 
 
244 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  85.66 
 
 
244 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  84.43 
 
 
244 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  83.2 
 
 
244 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  81.97 
 
 
244 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  82.38 
 
 
244 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  79.51 
 
 
244 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  60.56 
 
 
251 aa  316  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  51.61 
 
 
248 aa  273  1e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
248 aa  272  4e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  54.44 
 
 
248 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  54.44 
 
 
248 aa  269  3e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  48.25 
 
 
262 aa  230  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
251 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  38.72 
 
 
247 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  39.92 
 
 
243 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.34 
 
 
243 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
274 aa  186  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
285 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  43.44 
 
 
260 aa  184  1e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.35 
 
 
249 aa  184  2e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.08 
 
 
241 aa  183  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.52 
 
 
257 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.02 
 
 
259 aa  180  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.37535e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  40.5 
 
 
246 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  35.39 
 
 
252 aa  179  3e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  39.41 
 
 
246 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  41.05 
 
 
249 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  39.3 
 
 
273 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
369 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.23322e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
247 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  40.42 
 
 
252 aa  174  1e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  36.97 
 
 
245 aa  172  3e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  40.68 
 
 
266 aa  172  4e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  35.83 
 
 
240 aa  172  4e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  37.45 
 
 
275 aa  172  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.56 
 
 
312 aa  172  6e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
240 aa  171  7e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 
305 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.57 
 
 
253 aa  171  1e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 
259 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.65 
 
 
325 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  36.32 
 
 
293 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.82 
 
 
312 aa  169  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.27 
 
 
316 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  40 
 
 
236 aa  169  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 
339 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.01 
 
 
306 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  37.18 
 
 
270 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  39.29 
 
 
295 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  37.07 
 
 
318 aa  169  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  37.5 
 
 
311 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
356 aa  168  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 
245 aa  168  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.65 
 
 
339 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
312 aa  168  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.81 
 
 
305 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.75 
 
 
250 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.22 
 
 
307 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  39.07 
 
 
332 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  39.21 
 
 
339 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
255 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  37.18 
 
 
247 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.27 
 
 
337 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.35 
 
 
253 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36.6 
 
 
305 aa  166  3e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  36.61 
 
 
296 aa  166  3e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.01 
 
 
315 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
257 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
305 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.92 
 
 
512 aa  166  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
244 aa  165  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  38.33 
 
 
340 aa  165  6e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  38.24 
 
 
339 aa  165  7e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.93 
 
 
253 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
317 aa  164  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
279 aa  164  1e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  38.49 
 
 
249 aa  164  1e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  40.26 
 
 
299 aa  164  1e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.18 
 
 
309 aa  164  1e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  35.43 
 
 
258 aa  164  1e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.53 
 
 
337 aa  163  2e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.86 
 
 
279 aa  164  2e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.56 
 
 
339 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.56 
 
 
339 aa  163  2e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.61 
 
 
303 aa  163  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
308 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  35.59 
 
 
317 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.42 
 
 
321 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.64 
 
 
318 aa  162  4e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
309 aa  162  4e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>