More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0068 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0063  TonB-dependent receptor  99.62 
 
 
798 aa  1619  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0128619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0068  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 
798 aa  1516  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.21546e-05  unclonable  2.40632e-10 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  47.72 
 
 
882 aa  734  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02415  TonB-dependent receptor  53.69 
 
 
814 aa  834  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0067  outer membrane insertion C-terminal signal  99.37 
 
 
798 aa  1615  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00013463  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3988  TonB-dependent receptor  83.23 
 
 
798 aa  1333  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  2.35152e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0064  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 
798 aa  1516  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00224959  unclonable  4.16662e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0066  TonB-dependent receptor  93.73 
 
 
798 aa  1516  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000206959  hitchhiker  1.55765e-08 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4286  TonB-dependent receptor  99.25 
 
 
798 aa  1613  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.8092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0068  TonB-dependent receptor  100 
 
 
798 aa  1623  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00237309  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02625  TonB-dependent receptor  42.57 
 
 
836 aa  619  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107636  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3963  TonB-dependent receptor  43.39 
 
 
812 aa  613  1e-174  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  3.86767e-06  normal  0.0993256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3229  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 
875 aa  507  1e-142  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1881  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 
838 aa  409  1e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.490789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 
866 aa  313  6e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1434  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 
753 aa  275  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000294975  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3503  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 
754 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.216173  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2959  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
761 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.404716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0977  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
757 aa  257  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3961  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 
835 aa  256  2e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1822  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 
756 aa  240  6e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000398859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0305  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 
786 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.301005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04790  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 
793 aa  226  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0143  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 
864 aa  215  2e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556848  normal  0.758309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03378  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
798 aa  199  2e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0156374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4077  cyclic nucleotide-binding protein  25.5 
 
 
959 aa  190  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3280  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 
923 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322049  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3957  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
870 aa  177  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1484  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 
831 aa  167  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.135772  normal  0.425755 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0334  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
815 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  6.17894e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0866  TonB-dependent receptor  35.39 
 
 
879 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.250778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1883  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
702 aa  70.1  2e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118236  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  26.44 
 
 
753 aa  67  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 
750 aa  64.3  9e-09  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  27.45 
 
 
718 aa  63.2  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.3 
 
 
631 aa  62.8  3e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
705 aa  61.6  5e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 
703 aa  62  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 
703 aa  62  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  30 
 
 
729 aa  61.2  6e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  25.77 
 
 
739 aa  61.2  7e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  32.54 
 
 
745 aa  60.8  9e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 
747 aa  60.8  9e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 
747 aa  60.8  9e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 
747 aa  60.8  1e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 
747 aa  60.8  1e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 
747 aa  60.8  1e-07  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 
704 aa  60.5  1e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.79 
 
 
631 aa  60.5  1e-07  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.68 
 
 
653 aa  59.7  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 
747 aa  59.7  2e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 
703 aa  59.7  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 
790 aa  59.7  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 
688 aa  59.7  2e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.46 
 
 
656 aa  58.9  3e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.54 
 
 
747 aa  59.3  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  28.82 
 
 
778 aa  58.9  4e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  29.41 
 
 
729 aa  58.5  4e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  29.41 
 
 
729 aa  58.5  5e-07  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 
710 aa  58.2  5e-07  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  29.17 
 
 
646 aa  58.2  7e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.08252e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  26.97 
 
 
655 aa  57.8  8e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0570  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  27.68 
 
 
675 aa  57  1e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168599  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  28.65 
 
 
680 aa  57  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  28.22 
 
 
613 aa  57.4  1e-06  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  26.2 
 
 
620 aa  57  1e-06  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  30.77 
 
 
752 aa  56.2  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 
711 aa  56.2  2e-06  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  29.71 
 
 
729 aa  56.6  2e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 
614 aa  56.6  2e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  31.95 
 
 
747 aa  55.5  3e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  26.64 
 
 
665 aa  55.8  3e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
680 aa  55.8  3e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 
702 aa  55.8  3e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  26.76 
 
 
665 aa  55.5  4e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 
617 aa  55.5  4e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  26.76 
 
 
665 aa  55.5  4e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 
751 aa  55.1  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  28.74 
 
 
653 aa  55.1  5e-06  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 
696 aa  55.1  5e-06  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  26.47 
 
 
670 aa  55.1  5e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  31.75 
 
 
696 aa  55.1  5e-06  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 
751 aa  55.1  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 
806 aa  55.1  6e-06  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
720 aa  55.1  6e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
697 aa  54.7  6e-06  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 
751 aa  54.7  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 
751 aa  54.7  7e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 
628 aa  54.3  8e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  3.31916e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  26.23 
 
 
751 aa  54.3  8e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
698 aa  54.3  8e-06  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
698 aa  54.3  8e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 
698 aa  54.3  8e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
743 aa  54.3  8e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 
763 aa  54.3  9e-06  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  36.46 
 
 
731 aa  54.3  9e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  28.18 
 
 
665 aa  54.3  9e-06  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  25.66 
 
 
701 aa  53.9  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.65675e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
737 aa  53.5  1e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  2.31942e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  33.93 
 
 
712 aa  54.3  1e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>