More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0067 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  100 
 
 
406 aa  817    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  98.77 
 
 
406 aa  806    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  99.51 
 
 
406 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  86.88 
 
 
406 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  86.63 
 
 
406 aa  689    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  83.25 
 
 
406 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  99.51 
 
 
406 aa  814    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  86.88 
 
 
406 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  54.94 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  50.97 
 
 
425 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  52.66 
 
 
405 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  52.75 
 
 
415 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1824  major facilitator transporter  30.2 
 
 
415 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1438  major facilitator transporter  27.27 
 
 
415 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2963  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
421 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121972  normal  0.284618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3505  major facilitator transporter  28 
 
 
412 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0981  hypothetical protein  25.9 
 
 
415 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1433  transporter, MFS superfamily  25.94 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.811642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1261  major facilitator transporter  28.12 
 
 
406 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  26.87 
 
 
421 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4329  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  27.53 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0563  major facilitator transporter  23.14 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  23.99 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  23.68 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0306  major facilitator transporter  26.72 
 
 
409 aa  75.1  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.338859  normal  0.158126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  27.59 
 
 
431 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  27.06 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2947  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  27.06 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1434  major facilitator transporter  23.56 
 
 
432 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.75 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  27.7 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  24.75 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1407  major facilitator transporter  23.12 
 
 
447 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 
419 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  24.36 
 
 
409 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1398  major facilitator transporter  23.3 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7149  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
434 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.321926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  22.03 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.54 
 
 
505 aa  66.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.15 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  26.81 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  25.15 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  26.81 
 
 
408 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  23.58 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  22.03 
 
 
399 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  22.4 
 
 
450 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  23.16 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  25.25 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6132  major facilitator transporter  23.68 
 
 
403 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2270  major facilitator superfamily protein  23.81 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  25.67 
 
 
893 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  23.2 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 
480 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  24.01 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  22.82 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  22 
 
 
399 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  26.22 
 
 
428 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.77 
 
 
435 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  23.32 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  25 
 
 
426 aa  60.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  26.92 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  23.3 
 
 
438 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  22.9 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  20.83 
 
 
452 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  24.68 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  24.1 
 
 
426 aa  59.7  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  24.78 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6584  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
420 aa  59.7  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 
469 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  23.3 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  23.3 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  23.3 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  24.07 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.83 
 
 
478 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  21.77 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  23.3 
 
 
438 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  22.07 
 
 
453 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6102  major facilitator superfamily MFS_1  20.39 
 
 
452 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224126  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  21.77 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 
479 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.83 
 
 
479 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  25.66 
 
 
427 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  21.37 
 
 
453 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  21.71 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>