93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0062 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  98.78 
 
 
245 aa  469  1e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  92.65 
 
 
245 aa  443  1e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  5.46938e-08 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  93.06 
 
 
245 aa  445  1e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.8824e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  93.47 
 
 
245 aa  446  1e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  76.33 
 
 
247 aa  336  2e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  44.49 
 
 
249 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  1.66181e-09 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  43.5 
 
 
251 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  42.91 
 
 
257 aa  181  8e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  41.91 
 
 
252 aa  175  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  43.67 
 
 
252 aa  173  3e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.42874e-05 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  43.09 
 
 
251 aa  173  3e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  42.98 
 
 
244 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  42.68 
 
 
255 aa  168  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  41.37 
 
 
256 aa  163  2e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  40.08 
 
 
260 aa  158  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  38.1 
 
 
255 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  44.26 
 
 
246 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  43.21 
 
 
252 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  40.48 
 
 
252 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  35.71 
 
 
259 aa  145  7e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  36.67 
 
 
245 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  36.67 
 
 
245 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  37.08 
 
 
245 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  37.25 
 
 
250 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  38.31 
 
 
250 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
254 aa  136  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
254 aa  134  1e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  34.29 
 
 
244 aa  134  1e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  37.39 
 
 
255 aa  134  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  129  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  36.93 
 
 
261 aa  128  7e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  37.5 
 
 
253 aa  128  9e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  37.39 
 
 
276 aa  127  2e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  34.02 
 
 
282 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  38.43 
 
 
254 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  116  4e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  116  4e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  33.47 
 
 
260 aa  113  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
259 aa  108  7e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  35.29 
 
 
255 aa  105  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  38.8 
 
 
246 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  32.64 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  28.81 
 
 
301 aa  92.8  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  30.74 
 
 
246 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  29.95 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 
252 aa  84.7  1e-15  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  31 
 
 
240 aa  82.8  5e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  68.6  8e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  26.6 
 
 
252 aa  63.2  3e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  3.7107e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  29.17 
 
 
252 aa  60.8  2e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  25.41 
 
 
248 aa  53.9  2e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  25.54 
 
 
254 aa  53.1  4e-06  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  23.46 
 
 
261 aa  52.8  5e-06  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  25.2 
 
 
250 aa  52.4  7e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  32.43 
 
 
272 aa  52.4  7e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  40.18 
 
 
278 aa  52  9e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  28.76 
 
 
261 aa  50.1  3e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.61 
 
 
255 aa  50.1  3e-05  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  25.3 
 
 
253 aa  49.3  5e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  25.3 
 
 
251 aa  49.3  5e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  49.3  6e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  2.99502e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  25.85 
 
 
248 aa  48.5  9e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  30.06 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1292  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.404695  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  25.73 
 
 
247 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  28.7 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4754  protein of unknown function DUF81  25.85 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.180268  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4352  hypothetical protein  25.42 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.284869  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  25.22 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4876  protein of unknown function DUF81  25.42 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  24.47 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4525  hypothetical protein  29.13 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.542262  normal  0.388849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4658  hypothetical protein  29.26 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218581  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.12 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1495  membrane protein  29.92 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5700  hypothetical protein  28.3 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346849 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3764  hypothetical protein  28.3 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.260566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4604  hypothetical protein  28.3 
 
 
249 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.026301  normal  0.0214445 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1716  hypothetical protein  29.92 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1535  hypothetical protein  28.91 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.671723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1737  hypothetical protein  28.87 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.593381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1530  hypothetical protein  30.08 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1504  membrane protein  29.13 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000123127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1687  hypothetical protein  28.87 
 
 
241 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1649  hypothetical protein  30.08 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1794  hypothetical protein  28.87 
 
 
241 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3115  protein of unknown function DUF81  24.69 
 
 
238 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>