More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0059 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
557 aa  1144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  98.2 
 
 
557 aa  1126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  59.78 
 
 
559 aa  672  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  58.94 
 
 
566 aa  660  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  60.47 
 
 
581 aa  678  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  59.78 
 
 
559 aa  672  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  59.78 
 
 
559 aa  672  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  60.07 
 
 
563 aa  671  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  99.28 
 
 
557 aa  1139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  61.02 
 
 
581 aa  682  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 
557 aa  1144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  99.46 
 
 
557 aa  1139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  59.78 
 
 
565 aa  671  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  59.78 
 
 
565 aa  665  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  58.63 
 
 
566 aa  663  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  59.6 
 
 
559 aa  670  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  59.78 
 
 
565 aa  671  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  98.2 
 
 
557 aa  1126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  1.26428e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  59.78 
 
 
565 aa  671  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  59.78 
 
 
559 aa  672  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  59.78 
 
 
559 aa  672  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.01 
 
 
576 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.93 
 
 
576 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  34.15 
 
 
572 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.3 
 
 
578 aa  312  9e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.4237e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.46 
 
 
567 aa  305  2e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 
564 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.75265e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 
568 aa  294  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 
580 aa  290  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  32.15 
 
 
603 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  31.5 
 
 
589 aa  269  1e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  31.5 
 
 
589 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  31.33 
 
 
589 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  31.33 
 
 
589 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  31.33 
 
 
589 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  31.15 
 
 
589 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  31.33 
 
 
589 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  31.38 
 
 
589 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  33.92 
 
 
568 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  30.56 
 
 
587 aa  265  2e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  30.83 
 
 
589 aa  264  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 
591 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  31.58 
 
 
558 aa  258  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 
584 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  29.32 
 
 
584 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  32.22 
 
 
522 aa  249  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  32.17 
 
 
577 aa  249  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  30.31 
 
 
575 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  31.31 
 
 
565 aa  246  9e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  27.69 
 
 
591 aa  246  1e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  30.66 
 
 
576 aa  246  1e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  31.12 
 
 
565 aa  246  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0146  signal transduction histidine kinase, LytS  31.12 
 
 
565 aa  243  8e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.889074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  29.78 
 
 
572 aa  240  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 
572 aa  240  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  32.28 
 
 
558 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  30.39 
 
 
560 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  29.51 
 
 
557 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 
560 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  30 
 
 
556 aa  236  8e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  32.25 
 
 
556 aa  236  1e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 
556 aa  236  1e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  30.53 
 
 
558 aa  235  2e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  6.62994e-11 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 
569 aa  233  7e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  29.15 
 
 
565 aa  233  7e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0884  membrane signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
579 aa  230  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.14 
 
 
560 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
560 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0182  sensor histidine kinase, putative  28.01 
 
 
581 aa  226  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  28.6 
 
 
579 aa  226  7e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
565 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
565 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
565 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  30.07 
 
 
565 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.13246e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 
560 aa  224  5e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  36.06 
 
 
465 aa  220  6e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  30.62 
 
 
563 aa  219  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 
563 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  28.73 
 
 
561 aa  216  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  30.44 
 
 
561 aa  214  4e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  32.13 
 
 
560 aa  214  4e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 
559 aa  213  6e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  30.37 
 
 
561 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  30.37 
 
 
561 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  30.37 
 
 
561 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  30.37 
 
 
561 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.98 
 
 
562 aa  213  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 
558 aa  212  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
561 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  31.89 
 
 
561 aa  210  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.26 
 
 
561 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  30.29 
 
 
582 aa  209  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  29.48 
 
 
560 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  29.48 
 
 
560 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.43 
 
 
561 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  29.17 
 
 
568 aa  208  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.26 
 
 
561 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.26 
 
 
561 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.26 
 
 
561 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.26 
 
 
561 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>