More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0048 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  305  1e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.23958e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  99.33 
 
 
149 aa  305  2e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  89.93 
 
 
158 aa  286  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03873e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  94.44 
 
 
144 aa  283  6e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  91.67 
 
 
144 aa  281  2e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  91.67 
 
 
144 aa  281  3e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.63421e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  90.28 
 
 
144 aa  276  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  97.99 
 
 
149 aa  273  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  97.92 
 
 
144 aa  263  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  76.39 
 
 
144 aa  246  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  70.95 
 
 
170 aa  235  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  72.22 
 
 
144 aa  228  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  72.22 
 
 
144 aa  226  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  67.36 
 
 
144 aa  221  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  67.36 
 
 
144 aa  219  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  68.99 
 
 
130 aa  194  5e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  46.53 
 
 
144 aa  154  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  46.53 
 
 
144 aa  151  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
144 aa  146  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
144 aa  146  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  44.44 
 
 
144 aa  146  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  45.14 
 
 
144 aa  146  1e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  44.44 
 
 
144 aa  143  7e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  42.57 
 
 
148 aa  143  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  43.36 
 
 
143 aa  139  1e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  44.06 
 
 
143 aa  139  1e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
142 aa  136  9e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  44.06 
 
 
143 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  41.96 
 
 
143 aa  133  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
141 aa  133  1e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  41.26 
 
 
143 aa  132  1e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  42.66 
 
 
143 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  42.66 
 
 
143 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  42.66 
 
 
143 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  42.66 
 
 
143 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  42.66 
 
 
143 aa  132  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 
143 aa  131  4e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  39.29 
 
 
145 aa  120  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0174  rhodanese domain-containing protein  39.16 
 
 
143 aa  116  1e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  42.55 
 
 
141 aa  113  9e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  38.3 
 
 
141 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  37.06 
 
 
144 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 
144 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.88 
 
 
141 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  3.98103e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.64 
 
 
141 aa  100  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40 
 
 
138 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.64 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  34.03 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
145 aa  94  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  34.51 
 
 
141 aa  93.6  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  34.51 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.59 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.59 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  35.66 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  35.66 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  31.91 
 
 
141 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  30.07 
 
 
151 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  46.15 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  46.15 
 
 
139 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  33.1 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  37.68 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.59 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  27.46 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  84  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
140 aa  83.6  1e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.78 
 
 
123 aa  83.2  1e-15  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  32.62 
 
 
151 aa  82.8  1e-15  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  38.52 
 
 
132 aa  82  3e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.89 
 
 
141 aa  81.3  4e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
140 aa  80.5  8e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 
141 aa  80.1  8e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 
138 aa  80.1  8e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
135 aa  80.1  9e-15  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  1e-14  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  31.16 
 
 
140 aa  79.7  1e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  32.61 
 
 
149 aa  79.7  1e-14  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  31.16 
 
 
135 aa  79.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
138 aa  78.2  4e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  38.95 
 
 
141 aa  77.8  5e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 
128 aa  77.4  6e-14  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
124 aa  77  7e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  35.51 
 
 
137 aa  77  7e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  34.78 
 
 
137 aa  76.6  9e-14  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 
142 aa  76.6  9e-14  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>