234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0047 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  93.77 
 
 
514 aa  1009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  62.89 
 
 
511 aa  652  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  82.68 
 
 
514 aa  898  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  63.67 
 
 
511 aa  671  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  99.42 
 
 
514 aa  1058  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  81.71 
 
 
514 aa  885  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  66.99 
 
 
514 aa  714  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  66.99 
 
 
514 aa  714  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  67.18 
 
 
514 aa  717  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  68.54 
 
 
514 aa  737  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  94.36 
 
 
514 aa  1015  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  64.01 
 
 
510 aa  668  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  66.73 
 
 
510 aa  694  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.79445e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  65.95 
 
 
514 aa  717  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  63.09 
 
 
511 aa  654  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  62.14 
 
 
519 aa  646  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  66.21 
 
 
514 aa  714  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  93.77 
 
 
514 aa  1008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  81.76 
 
 
513 aa  890  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  64.98 
 
 
515 aa  686  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  93.58 
 
 
514 aa  1008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.85111e-06 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  64.91 
 
 
511 aa  696  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  66.6 
 
 
514 aa  720  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  67.58 
 
 
510 aa  715  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  66.41 
 
 
514 aa  718  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  82.03 
 
 
513 aa  877  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  65.11 
 
 
509 aa  708  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  82.49 
 
 
514 aa  905  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  66.99 
 
 
514 aa  714  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  59.69 
 
 
516 aa  637  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  66.99 
 
 
514 aa  714  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  67.38 
 
 
515 aa  711  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  63.01 
 
 
508 aa  679  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  66.99 
 
 
514 aa  714  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  67.18 
 
 
515 aa  709  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  64.38 
 
 
510 aa  685  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  93.77 
 
 
514 aa  1011  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  81.91 
 
 
514 aa  891  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.56408e-05 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  65.05 
 
 
520 aa  692  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  68.48 
 
 
514 aa  731  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  79.38 
 
 
514 aa  870  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  99.03 
 
 
514 aa  1055  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  6.62777e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  63.87 
 
 
511 aa  686  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  100 
 
 
514 aa  1067  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.66466e-05 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  67.18 
 
 
514 aa  716  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  66.99 
 
 
514 aa  714  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  64.24 
 
 
516 aa  682  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  66.99 
 
 
514 aa  714  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  66.41 
 
 
514 aa  718  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  64.06 
 
 
511 aa  688  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  65.04 
 
 
515 aa  697  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  99.22 
 
 
514 aa  1057  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  63.48 
 
 
511 aa  684  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  67.38 
 
 
515 aa  711  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  66.21 
 
 
510 aa  702  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  63.8 
 
 
529 aa  683  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  60.71 
 
 
509 aa  622  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  58.17 
 
 
517 aa  623  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  57.72 
 
 
525 aa  611  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  57.47 
 
 
530 aa  605  1e-172  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  57.88 
 
 
552 aa  598  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  57.51 
 
 
513 aa  592  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  56.86 
 
 
519 aa  589  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  56.86 
 
 
519 aa  588  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 
509 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  59.65 
 
 
509 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  56.78 
 
 
517 aa  582  1e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 
552 aa  580  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  54.1 
 
 
517 aa  573  1e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  53.59 
 
 
518 aa  565  1e-160  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  56.08 
 
 
521 aa  561  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  55.23 
 
 
505 aa  560  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3511  phosphoglyceromutase  52.82 
 
 
518 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  51.72 
 
 
525 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  52.46 
 
 
512 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
514 aa  549  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  53.95 
 
 
514 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  51.56 
 
 
512 aa  544  1e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  51.95 
 
 
512 aa  545  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
512 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  53.73 
 
 
512 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  52.43 
 
 
516 aa  541  1e-152  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  52.28 
 
 
514 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  53.05 
 
 
516 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  53.03 
 
 
510 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  52.64 
 
 
512 aa  528  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.41854e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  51.38 
 
 
521 aa  527  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 
513 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 
512 aa  527  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  51.96 
 
 
514 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 
513 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  7.77024e-06  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  51.37 
 
 
511 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.5941e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  53.11 
 
 
514 aa  524  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  7.29439e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 
516 aa  521  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 
516 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  51.08 
 
 
515 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0275  phosphoglyceromutase  51.27 
 
 
515 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.206526  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  52.94 
 
 
523 aa  515  1e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 
509 aa  516  1e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  53.24 
 
 
512 aa  517  1e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.45113e-12  unclonable  3.71745e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>