More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0045 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  86.28 
 
 
401 aa  683  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  99.25 
 
 
401 aa  813  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.23993e-09 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  86.78 
 
 
401 aa  686  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.24234e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  82.04 
 
 
402 aa  655  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  85.54 
 
 
401 aa  679  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  99.5 
 
 
401 aa  816  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  99 
 
 
401 aa  811  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
401 aa  819  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.44504e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  77.81 
 
 
402 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  61.56 
 
 
401 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  62.81 
 
 
401 aa  516  1e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  5.24725e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  60.85 
 
 
398 aa  493  1e-138  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  60.55 
 
 
401 aa  494  1e-138  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  61.06 
 
 
401 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  56.42 
 
 
401 aa  465  1e-130  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
429 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.89 
 
 
446 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.3 
 
 
426 aa  270  3e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 
443 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  2.0194e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  41.43 
 
 
433 aa  267  3e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 
432 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
428 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 
415 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 
428 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 
440 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 
452 aa  254  2e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.98409e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 
422 aa  253  4e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
438 aa  252  8e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
438 aa  252  9e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
438 aa  252  9e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  36.55 
 
 
440 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  40.56 
 
 
439 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 
438 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 
438 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.06 
 
 
445 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 
441 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.47 
 
 
451 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 
439 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 
437 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.06 
 
 
445 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.56 
 
 
461 aa  249  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.76 
 
 
462 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.93 
 
 
441 aa  249  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
451 aa  249  8e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 
457 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 
456 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 
458 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 
436 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 
436 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.08 
 
 
423 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 
452 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 
447 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
423 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.06 
 
 
439 aa  246  7e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  38.25 
 
 
463 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.44 
 
 
445 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.44 
 
 
445 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.53 
 
 
410 aa  245  1e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.15 
 
 
444 aa  245  1e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 
440 aa  244  2e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  38.38 
 
 
445 aa  244  2e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  38.38 
 
 
442 aa  244  2e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 
440 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.64 
 
 
444 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.97536e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
440 aa  243  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
440 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 
444 aa  243  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.24 
 
 
443 aa  243  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 
507 aa  242  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  39.63 
 
 
437 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 
440 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  39.27 
 
 
437 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  35.39 
 
 
446 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  39.33 
 
 
437 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
424 aa  239  6e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  40.62 
 
 
456 aa  239  7e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.21 
 
 
455 aa  239  7e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.93491e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
468 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
424 aa  239  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 
440 aa  239  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 
444 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  1.17328e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 
515 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 
444 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  37.46 
 
 
438 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 
455 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.16068e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 
515 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 
515 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  35.68 
 
 
515 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  40.31 
 
 
456 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 
444 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  38.08 
 
 
498 aa  236  5e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 
444 aa  236  5e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.17 
 
 
440 aa  236  6e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 
513 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.32 
 
 
443 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.57328e-06  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  37.1 
 
 
437 aa  235  1e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.64 
 
 
440 aa  235  1e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 
439 aa  235  1e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  5.62456e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  38.44 
 
 
419 aa  235  1e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.92 
 
 
444 aa  235  1e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>