103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0032 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  84.31 
 
 
374 aa  676  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43599e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  99.73 
 
 
376 aa  769  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  84.57 
 
 
374 aa  676  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  82.54 
 
 
378 aa  657  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  99.73 
 
 
376 aa  769  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35775e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  84.31 
 
 
374 aa  675  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  99.73 
 
 
376 aa  768  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
376 aa  771  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  80.32 
 
 
374 aa  637  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  65.23 
 
 
367 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  64.88 
 
 
369 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  63.88 
 
 
365 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  61.58 
 
 
362 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  60.16 
 
 
369 aa  471  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  60.11 
 
 
368 aa  471  1e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  61.58 
 
 
346 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  35.69 
 
 
345 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  37.25 
 
 
360 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  34.5 
 
 
338 aa  214  2e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  34.23 
 
 
361 aa  206  4e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  34.68 
 
 
341 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  34.3 
 
 
341 aa  206  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  33.72 
 
 
341 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  32.81 
 
 
352 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  33.14 
 
 
341 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.9767e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  32.65 
 
 
383 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  32.37 
 
 
341 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  32.66 
 
 
341 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  29.41 
 
 
403 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  31.92 
 
 
338 aa  183  4e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  33.42 
 
 
364 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  34.12 
 
 
391 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  32.39 
 
 
394 aa  175  1e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  33.06 
 
 
364 aa  175  1e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.09 
 
 
393 aa  173  4e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.46 
 
 
389 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  30.27 
 
 
345 aa  170  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  31.54 
 
 
353 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  30.6 
 
 
350 aa  163  4e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  29.46 
 
 
377 aa  163  5e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  28.93 
 
 
377 aa  158  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  32.23 
 
 
401 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  31.02 
 
 
377 aa  152  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  32.18 
 
 
359 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 
349 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  28.49 
 
 
345 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  30.2 
 
 
387 aa  148  2e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  28.23 
 
 
345 aa  147  4e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  29.49 
 
 
417 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  31.48 
 
 
367 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  28.8 
 
 
343 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  30.95 
 
 
366 aa  142  9e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 
426 aa  141  2e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  29.92 
 
 
420 aa  140  4e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  27.35 
 
 
341 aa  140  4e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  30.69 
 
 
419 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  29.58 
 
 
395 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  29.3 
 
 
364 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  28.38 
 
 
409 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  29.16 
 
 
405 aa  133  4e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  28.85 
 
 
388 aa  131  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  28 
 
 
390 aa  130  4e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  28.14 
 
 
349 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  28.14 
 
 
349 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  28.12 
 
 
408 aa  122  1e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  26.99 
 
 
358 aa  120  4e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  28.28 
 
 
384 aa  118  1e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  28.64 
 
 
384 aa  115  2e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  27.02 
 
 
333 aa  114  2e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.0411e-06  hitchhiker  3.23717e-12 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  25.53 
 
 
430 aa  114  4e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  28.28 
 
 
429 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  26.42 
 
 
331 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  27.84 
 
 
335 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  27.15 
 
 
340 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.7016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  25.2 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.22112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  28.57 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  25.75 
 
 
440 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  25.75 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  25.83 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 
335 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  24.93 
 
 
435 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  25.58 
 
 
338 aa  85.5  1e-15  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  24.1 
 
 
394 aa  74.7  3e-12  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.01658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  51.11 
 
 
377 aa  51.6  2e-05  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  22.17 
 
 
329 aa  50.1  7e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  41.82 
 
 
356 aa  50.1  7e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  38.71 
 
 
935 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  35 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 
195 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.273127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 
1051 aa  46.2  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  37.93 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2725  5'-nucleotidase-like  37.5 
 
 
663 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  38 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  30.34 
 
 
543 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  45.24 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 
161 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  39.66 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2148  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 
160 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00099645  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  35.48 
 
 
161 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 
207 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>