232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0027 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  75.21 
 
 
480 aa  740  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  83.12 
 
 
480 aa  798  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  92.92 
 
 
480 aa  881  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  93.96 
 
 
480 aa  895  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  95 
 
 
480 aa  896  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  95.42 
 
 
480 aa  899  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
480 aa  965  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
480 aa  965  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  83.33 
 
 
480 aa  801  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  81.25 
 
 
480 aa  747  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
480 aa  965  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  100 
 
 
480 aa  965  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  95 
 
 
480 aa  895  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  78.12 
 
 
480 aa  778  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  80.42 
 
 
480 aa  773  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  58.21 
 
 
481 aa  566  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  57.29 
 
 
481 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  57.5 
 
 
481 aa  558  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  55.77 
 
 
481 aa  503  1e-141  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  54.57 
 
 
483 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  53.96 
 
 
483 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  54.43 
 
 
484 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  53.59 
 
 
484 aa  465  1e-130  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  50.54 
 
 
484 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  52.3 
 
 
484 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  52.82 
 
 
484 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  53.24 
 
 
484 aa  461  1e-128  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  50.11 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  50.33 
 
 
484 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  50 
 
 
484 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  49.89 
 
 
484 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  50.21 
 
 
484 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  50.54 
 
 
484 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  48.6 
 
 
484 aa  446  1e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  48.82 
 
 
484 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  48.09 
 
 
490 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  47.01 
 
 
472 aa  407  1e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.33 
 
 
481 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  42.68 
 
 
482 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  41.74 
 
 
482 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  49.32 
 
 
493 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  40.37 
 
 
482 aa  358  1e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  40.33 
 
 
485 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  42.42 
 
 
498 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  40.95 
 
 
466 aa  339  6e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  42.08 
 
 
466 aa  333  5e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  41.09 
 
 
500 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  45.24 
 
 
498 aa  328  2e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  36.59 
 
 
482 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  40.56 
 
 
466 aa  315  1e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  35.42 
 
 
478 aa  313  4e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  39.21 
 
 
484 aa  312  7e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  36.34 
 
 
481 aa  311  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  37.68 
 
 
484 aa  308  2e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.68 
 
 
484 aa  307  4e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  38.49 
 
 
510 aa  306  6e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  36.57 
 
 
482 aa  303  4e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  36.57 
 
 
482 aa  303  4e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  37.89 
 
 
484 aa  302  8e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  38.48 
 
 
484 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  38.92 
 
 
488 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.82 
 
 
485 aa  292  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.4 
 
 
481 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.58 
 
 
494 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  35.11 
 
 
485 aa  287  3e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.19 
 
 
483 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.16 
 
 
482 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.56 
 
 
483 aa  285  2e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  33.47 
 
 
479 aa  285  2e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.69 
 
 
466 aa  283  4e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  36.46 
 
 
488 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  34.63 
 
 
485 aa  281  2e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  33.61 
 
 
479 aa  280  3e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  33.13 
 
 
483 aa  280  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  32.92 
 
 
485 aa  279  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  36.8 
 
 
478 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  35.68 
 
 
483 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  36.63 
 
 
484 aa  276  6e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  38.98 
 
 
484 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  34.69 
 
 
498 aa  275  1e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  35.59 
 
 
483 aa  274  2e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  34.99 
 
 
485 aa  273  5e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  37.47 
 
 
485 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  35.22 
 
 
498 aa  272  1e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  34.02 
 
 
488 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  33.95 
 
 
491 aa  271  3e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  34.92 
 
 
483 aa  270  3e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  34.02 
 
 
488 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.12 
 
 
482 aa  268  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  34.17 
 
 
476 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  34.66 
 
 
481 aa  267  3e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  34.24 
 
 
482 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.97 
 
 
483 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  36.44 
 
 
482 aa  263  4e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.21 
 
 
491 aa  263  5e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  34.22 
 
 
487 aa  263  6e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  35.66 
 
 
485 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  35.25 
 
 
485 aa  260  3e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  33 
 
 
487 aa  259  7e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  34.19 
 
 
486 aa  258  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>