278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0023 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0023  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
485 aa  976  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  0.0148489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  67.63 
 
 
483 aa  646  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2536  potassium uptake protein TrkH  69.07 
 
 
485 aa  641  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.77354e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0021  TrkH family potassium uptake protein  96.91 
 
 
485 aa  902  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  1.91681e-06  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  92.18 
 
 
486 aa  863  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  83.92 
 
 
485 aa  825  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  96.29 
 
 
485 aa  897  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  82.89 
 
 
485 aa  821  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  65.36 
 
 
483 aa  678  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 
485 aa  805  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0019  TrkH family potassium uptake protein  96.7 
 
 
485 aa  900  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000172617  normal  0.0765099 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0024  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
485 aa  976  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0989593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  88.87 
 
 
485 aa  862  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001986  potassium uptake protein TrkH  68.87 
 
 
485 aa  635  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00100694  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  64.49 
 
 
488 aa  648  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  83.51 
 
 
485 aa  822  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  83.92 
 
 
485 aa  823  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  84.12 
 
 
485 aa  811  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0027  TrkH family potassium uptake protein  96.91 
 
 
485 aa  902  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0260602  hitchhiker  3.66479e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0023  potassium uptake protein, TrkH family  100 
 
 
485 aa  976  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.99675e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0019  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
485 aa  976  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.195703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  65.98 
 
 
483 aa  628  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  65.57 
 
 
483 aa  630  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2976  Trk system potassium uptake protein TrkH  69.07 
 
 
485 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00462  potassium uptake protein TrkH  69.28 
 
 
485 aa  627  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4041  potassium transporter  65.15 
 
 
483 aa  625  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.011777  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4265  potassium transporter  66.19 
 
 
483 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0305009  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4372  potassium transporter  66.19 
 
 
483 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0170672  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4216  potassium transporter  66.19 
 
 
483 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.96268e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4193  potassium transporter  66.19 
 
 
483 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000606727  normal  0.556467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4312  potassium transporter  66.19 
 
 
483 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0637309  normal  0.15299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4231  potassium transporter  65.15 
 
 
483 aa  625  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00335322  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3946  potassium transporter  65.15 
 
 
483 aa  622  1e-177  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000895633  decreased coverage  0.00222416 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4161  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100489  decreased coverage  3.37879e-06 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4132  potassium uptake protein, TrkH family  64.95 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.1848e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03740  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0315647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5288  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.58223e-06  normal  0.0471596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4072  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.58715e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4368  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.85721e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4319  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  620  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.19761e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4230  potassium transporter  64.95 
 
 
483 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.16067e-05  normal  0.0142841 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03689  hypothetical protein  64.95 
 
 
483 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.025775  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  63.3 
 
 
483 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  66.8 
 
 
483 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0286  potassium transporter  66.6 
 
 
483 aa  611  1e-174  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.8042e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3930  potassium transporter  66.8 
 
 
483 aa  612  1e-174  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.59691e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1915  potassium transporter  66.8 
 
 
483 aa  612  1e-174  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.78342e-06  normal  0.154047 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  58.56 
 
 
482 aa  592  1e-168  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  58.14 
 
 
483 aa  565  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  58.14 
 
 
483 aa  564  1e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2873  K+ transporter Trk  56.7 
 
 
482 aa  538  1e-152  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  55.17 
 
 
483 aa  540  1e-152  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  56.58 
 
 
483 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  54.64 
 
 
482 aa  529  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  55.23 
 
 
484 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  50.52 
 
 
481 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  48.87 
 
 
487 aa  465  1e-130  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2078  potassium uptake protein, TrkH family  48.41 
 
 
483 aa  453  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  48.31 
 
 
488 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  41.74 
 
 
486 aa  416  1e-115  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  41.49 
 
 
485 aa  406  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  44.1 
 
 
485 aa  407  1e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  43.71 
 
 
491 aa  406  1e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  44.93 
 
 
485 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  42.11 
 
 
474 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  40.41 
 
 
486 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  42.71 
 
 
485 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  42.68 
 
 
488 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  42.21 
 
 
481 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  43.17 
 
 
484 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  41.03 
 
 
488 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  40.21 
 
 
498 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  40.82 
 
 
488 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  44.26 
 
 
481 aa  369  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  40.25 
 
 
479 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  43.43 
 
 
485 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  42.21 
 
 
482 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  39.74 
 
 
482 aa  338  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  40.98 
 
 
483 aa  335  1e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  40.41 
 
 
482 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  37.78 
 
 
479 aa  328  1e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  42.15 
 
 
494 aa  325  8e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  36.11 
 
 
478 aa  325  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  40 
 
 
476 aa  322  7e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  38.15 
 
 
466 aa  322  1e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  39.26 
 
 
477 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  37.32 
 
 
491 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  38.91 
 
 
498 aa  310  5e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  38.7 
 
 
483 aa  307  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  38.24 
 
 
485 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  35.45 
 
 
481 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  39.91 
 
 
480 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  34.9 
 
 
485 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.89 
 
 
478 aa  297  3e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  35.77 
 
 
481 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  35.04 
 
 
481 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  34.98 
 
 
483 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  36.38 
 
 
484 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  38.27 
 
 
486 aa  290  5e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  8.47661e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  36.25 
 
 
484 aa  287  3e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>