More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0020 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4316  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.34 
 
 
729 aa  853  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.54826  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4213  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.76 
 
 
729 aa  855  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25080  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.66 
 
 
715 aa  876  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4369  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.76 
 
 
771 aa  857  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2974  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.71 
 
 
726 aa  919  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  100 
 
 
716 aa  1459  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0214886  normal  0.0135519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5285  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.06 
 
 
729 aa  871  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.427005  normal  0.014724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00460  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  64.02 
 
 
723 aa  927  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0020  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.72 
 
 
716 aa  1457  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56561e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.2 
 
 
729 aa  852  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00427861  hitchhiker  0.00453732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0015  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  89.94 
 
 
716 aa  1285  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000759827  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.72 
 
 
716 aa  1458  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283529  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0019  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  84.78 
 
 
716 aa  1191  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00182619  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0261  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  65.55 
 
 
729 aa  938  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.86607  normal  0.0441662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.73 
 
 
729 aa  912  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2145  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  62.66 
 
 
715 aa  874  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  84.5 
 
 
716 aa  1189  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0734076  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.15 
 
 
717 aa  1210  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  88.97 
 
 
716 aa  1271  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4365  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.06 
 
 
729 aa  851  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0869233  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0023  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  85.06 
 
 
716 aa  1202  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.62 
 
 
715 aa  795  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4069  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.34 
 
 
729 aa  857  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0033982  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  99.58 
 
 
716 aa  1457  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000906563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0201  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.36 
 
 
719 aa  917  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4262  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.76 
 
 
729 aa  855  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4309  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.76 
 
 
771 aa  857  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.956942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0018  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  95.53 
 
 
716 aa  1325  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0281216  hitchhiker  0.000170184 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.21 
 
 
719 aa  774  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4190  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.62 
 
 
729 aa  856  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0458015  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0016  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  95.39 
 
 
716 aa  1323  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00124169  normal  0.0928746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03736  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.78 
 
 
716 aa  897  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  58.17 
 
 
727 aa  793  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1652  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.26 
 
 
715 aa  857  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1578  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.49 
 
 
716 aa  811  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001988  fatty oxidation complex alpha subunit FadB  64.16 
 
 
723 aa  924  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4234  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.87 
 
 
729 aa  895  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.535693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3290  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60 
 
 
721 aa  848  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0906182  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0024  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  95.39 
 
 
716 aa  1325  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00830663  hitchhiker  4.74346e-08 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.73 
 
 
729 aa  912  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3517  fatty oxidation complex, alpha subunit  59.72 
 
 
721 aa  848  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.330047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.75 
 
 
715 aa  849  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.281306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0021  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  95.25 
 
 
716 aa  1323  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1580  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.54 
 
 
715 aa  856  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120976  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3606  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.75 
 
 
715 aa  853  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.28427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0393  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.4 
 
 
722 aa  858  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2534  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  65.55 
 
 
723 aa  945  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.386757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2136  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  60.75 
 
 
715 aa  850  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434411  normal  0.123544 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4135  fatty oxidation complex, alpha subunit FadB  61.2 
 
 
729 aa  873  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1144  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  59.02 
 
 
715 aa  842  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00169331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03737  fused 3-hydroxybutyryl-CoA epimerase/delta(3)-cis-delta(2)-trans-enoyl-CoA isomerase/enoyl-CoA hydratase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  61.2 
 
 
729 aa  854  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  56.76 
 
 
719 aa  781  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3933  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  63.73 
 
 
729 aa  912  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.04 
 
 
719 aa  796  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16390  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  50.21 
 
 
710 aa  672  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3879  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.54 
 
 
715 aa  854  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3949  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.76 
 
 
729 aa  864  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.706953  normal  0.0634882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1605  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  53.84 
 
 
721 aa  723  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  4.36351e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0013  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  98.46 
 
 
716 aa  1442  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000142726  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3747  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  55.8 
 
 
730 aa  805  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4164  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  61.34 
 
 
729 aa  853  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222596 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03686  hypothetical protein  61.2 
 
 
729 aa  854  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0032  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  86.13 
 
 
716 aa  1196  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58594  normal  0.0455208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  57.42 
 
 
729 aa  818  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4044  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  64.29 
 
 
729 aa  905  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1395  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  44.55 
 
 
715 aa  589  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1660  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  47.41 
 
 
722 aa  588  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2350  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  44.9 
 
 
711 aa  573  1e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702817  normal  0.449344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2604  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  37.19 
 
 
724 aa  441  1e-122  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110209  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2111  short chain enoyl-CoA hydratase / 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  38.12 
 
 
714 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.344014 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1733  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.46 
 
 
744 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.535937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1629  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.87 
 
 
715 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.895951  normal  0.0132209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2881  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.69 
 
 
715 aa  411  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.452872  normal  0.163686 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2492  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.1 
 
 
714 aa  407  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2821  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.98 
 
 
727 aa  407  1e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1444  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.29 
 
 
727 aa  405  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2780  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.04 
 
 
706 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2760  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.18 
 
 
706 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3456  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  36.55 
 
 
752 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0405944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.18 
 
 
706 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  5.61354e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2167  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.97 
 
 
706 aa  400  1e-110  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359385  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2855  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.9 
 
 
706 aa  400  1e-110  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2676  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.22 
 
 
710 aa  399  1e-110  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3088  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.97 
 
 
707 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1473  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.78 
 
 
709 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.451706  normal  0.0332103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2459  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.04 
 
 
706 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.740158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0565  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.05 
 
 
708 aa  395  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.486274  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3026  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.25 
 
 
713 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144673  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1461  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.64 
 
 
709 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.22255e-05 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1530  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.13 
 
 
708 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02700  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.86 
 
 
719 aa  395  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1408  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.78 
 
 
709 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.682572  hitchhiker  0.000547588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2598  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.98 
 
 
706 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2425  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  38.61 
 
 
706 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0429778 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3484  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.51 
 
 
714 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.591904  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2500  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.55 
 
 
714 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02265  fused enoyl-CoA hydratase and epimerase and isomerase/3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  36.1 
 
 
714 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02226  hypothetical protein  36.1 
 
 
714 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2637  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  36.24 
 
 
714 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2742  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  37.45 
 
 
715 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>