More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0006 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0006  monoheme cytochrome c  100 
 
 
100 aa  212  1e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0006  monoheme cytochrome c  98 
 
 
100 aa  207  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0006  monoheme cytochrome c  98 
 
 
100 aa  207  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.73885e-10 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0714  monoheme cytochrome c  86 
 
 
100 aa  183  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  51.04 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1176  cytochrome c class I  54.79 
 
 
110 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  8.69093e-06 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  48.44 
 
 
100 aa  70.5  8e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  37.63 
 
 
318 aa  69.3  2e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  45.83 
 
 
98 aa  67.4  7e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2701  cytochrome c, class I  40.74 
 
 
109 aa  65.5  2e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.487536  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  38.71 
 
 
111 aa  65.9  2e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  48.44 
 
 
200 aa  65.1  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  32.65 
 
 
103 aa  64.7  4e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  43.21 
 
 
221 aa  64.3  5e-10  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  36.84 
 
 
199 aa  63.2  1e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  39.19 
 
 
98 aa  62.4  2e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  37.5 
 
 
109 aa  62.4  2e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  47.46 
 
 
107 aa  61.6  3e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  36.71 
 
 
194 aa  61.6  3e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  36.25 
 
 
206 aa  61.2  4e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  9.8516e-08 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  33.71 
 
 
195 aa  61.2  4e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  39.51 
 
 
206 aa  60.8  5e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  41.25 
 
 
196 aa  60.8  6e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  36.76 
 
 
219 aa  60.8  6e-09  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  41.18 
 
 
108 aa  60.8  6e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  34.69 
 
 
105 aa  60.5  8e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  39.68 
 
 
198 aa  60.5  8e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  36.76 
 
 
219 aa  60.5  8e-09  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  36.76 
 
 
219 aa  60.5  8e-09  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  36.49 
 
 
105 aa  60.1  9e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  36.23 
 
 
198 aa  60.1  9e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  39.68 
 
 
106 aa  60.1  9e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  40.26 
 
 
219 aa  60.1  9e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  36.36 
 
 
238 aa  60.1  1e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  31.58 
 
 
113 aa  59.7  1e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.19911e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  40.85 
 
 
242 aa  59.7  1e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  41.27 
 
 
107 aa  58.9  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  39.68 
 
 
108 aa  59.3  2e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  38.1 
 
 
205 aa  58.9  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  38.04 
 
 
200 aa  59.3  2e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  39.71 
 
 
112 aa  58.2  3e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  38.1 
 
 
112 aa  58.5  3e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4466  cytochrome c class I  34.62 
 
 
230 aa  58.2  3e-08  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  28.57 
 
 
220 aa  57.8  4e-08  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  36.96 
 
 
200 aa  57.8  4e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5681  cytochrome c class I  37.97 
 
 
226 aa  58.2  4e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.670247  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  38.03 
 
 
188 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  34.94 
 
 
198 aa  57.8  5e-08  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  34.72 
 
 
213 aa  57.8  6e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  40 
 
 
255 aa  57.4  6e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0979  cytochrome c class I  38.16 
 
 
136 aa  57.4  7e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  38.89 
 
 
200 aa  57  8e-08  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  40.96 
 
 
179 aa  57  8e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  41.54 
 
 
226 aa  57  8e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  39.71 
 
 
200 aa  56.6  1e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1173  cytochrome c class I  41.27 
 
 
136 aa  56.2  1e-07  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  7.26448e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  31.17 
 
 
212 aa  56.2  1e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  38.03 
 
 
246 aa  56.6  1e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  34.78 
 
 
193 aa  56.2  1e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  35.38 
 
 
218 aa  56.2  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
115 aa  55.8  2e-07  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.75 
 
 
202 aa  55.8  2e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  34.92 
 
 
116 aa  55.8  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  36 
 
 
222 aa  55.5  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  41.54 
 
 
222 aa  55.5  3e-07  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  41.54 
 
 
222 aa  55.5  3e-07  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  38.57 
 
 
205 aa  55.1  3e-07  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  45.45 
 
 
196 aa  55.1  3e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  34.92 
 
 
191 aa  54.7  4e-07  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  34.12 
 
 
102 aa  54.3  5e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  3.35471e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  35.63 
 
 
270 aa  54.7  5e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  37.5 
 
 
153 aa  54.3  5e-07  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3138  cytochrome c, class I  32.63 
 
 
205 aa  54.3  6e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  40.98 
 
 
225 aa  53.9  6e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2026  cytochrome c, class IC  38.33 
 
 
107 aa  54.3  6e-07  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  44.78 
 
 
218 aa  53.5  8e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  35.29 
 
 
104 aa  53.5  9e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  32.05 
 
 
115 aa  53.5  9e-07  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
211 aa  53.5  9e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  40 
 
 
206 aa  53.1  1e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.56417e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5765  cytochrome c4, putative  37.5 
 
 
235 aa  53.1  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524274  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0987  cytochrome c, class I  32.05 
 
 
114 aa  53.5  1e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  39.68 
 
 
266 aa  53.5  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  37.66 
 
 
201 aa  53.1  1e-06  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1530  cytochrome c class I  40 
 
 
209 aa  53.5  1e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  30.77 
 
 
221 aa  52.8  1e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2894  cytochrome c, class I  31.08 
 
 
226 aa  53.5  1e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  38.03 
 
 
221 aa  53.1  1e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  33.33 
 
 
207 aa  52  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  41.18 
 
 
209 aa  52.4  2e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  30.77 
 
 
224 aa  52.8  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  33.33 
 
 
207 aa  52  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  4.02028e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  33.33 
 
 
207 aa  52  2e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  32.26 
 
 
207 aa  52.4  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  37.5 
 
 
240 aa  52.8  2e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  40.98 
 
 
212 aa  52.4  2e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  35.29 
 
 
225 aa  52.8  2e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2349  cytochrome c class I  44.93 
 
 
219 aa  52.8  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461178  hitchhiker  9.78123e-08 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2727  cytochrome c4  44.93 
 
 
217 aa  52.8  2e-06  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  39.34 
 
 
223 aa  52  2e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>