35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4746 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  99.53 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  99.53 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  99.06 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  99.06 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  99.06 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  98.58 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  85.85 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  85.85 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  85.38 
 
 		 211 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  85.38 
 
 		 211 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  85.38 
 
 		 211 aa  344  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  83.96 
 
 		 209 aa  332  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  73.83 
 
 		 210 aa  304  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  43.48 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  43.48 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  37.62 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  37.26 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  40 
 
 		 234 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  41.75 
 
 		 239 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  39.23 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  38.79 
 
 		 216 aa  88.2  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  30.17 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  36.05 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  32.94 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  59.57 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  24.44 
 
 		 439 aa  52.4  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  32.93 
 
 		 402 aa  52.4  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  27.46 
 
 		 470 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  24.87 
 
 		 441 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  25.28 
 
 		 475 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  24.59 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  24.59 
 
 		 473 aa  42  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  24.59 
 
 		 475 aa  42  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  23.53 
 
 		 468 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>