More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4544 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03923  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  98.78 
 
 
327 aa  656    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  98.47 
 
 
327 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4512  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  98.78 
 
 
327 aa  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5553  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  99.08 
 
 
327 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4544  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  100 
 
 
327 aa  668    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03883  hypothetical protein  98.78 
 
 
327 aa  656    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3977  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  98.78 
 
 
327 aa  656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.250547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4603  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  99.08 
 
 
327 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4291  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  99.08 
 
 
327 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4493  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  88.99 
 
 
327 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966191  normal  0.0601641 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4588  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  88.99 
 
 
327 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4639  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  88.69 
 
 
327 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0687735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4587  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  89.3 
 
 
327 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4502  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  88.69 
 
 
327 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0255  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  87.46 
 
 
327 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.263787  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3497  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  75.54 
 
 
327 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3635  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  74.92 
 
 
328 aa  504  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0742  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  74.62 
 
 
329 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0710  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  74.31 
 
 
331 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3766  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  73.39 
 
 
327 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252302  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3856  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  73.09 
 
 
327 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.323591  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4450  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  71.56 
 
 
329 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.553295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.47 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0088  alcohol dehydrogenase  61.77 
 
 
325 aa  407  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000155478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0091  alcohol dehydrogenase  60.24 
 
 
325 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.547437  hitchhiker  0.0000221127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0072  quinone oxidoreductase  60.55 
 
 
325 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.899686  hitchhiker  0.0000690857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0088  alcohol dehydrogenase  60.86 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0021  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  59.63 
 
 
325 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00189953  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0059  alcohol dehydrogenase  60.24 
 
 
325 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00210  NADH-quinone oxidoreductase  57.49 
 
 
325 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0024  quinone oxidoreductase  57.49 
 
 
325 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00250  quinone oxidoreductase  58.1 
 
 
325 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0756  putative quinone oxidoreductase  74.7 
 
 
257 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000103949  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0023  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  58.41 
 
 
325 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0173  quinone oxidoreductase  57.49 
 
 
325 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2969  alcohol dehydrogenase  52.29 
 
 
324 aa  343  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1258  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.13 
 
 
328 aa  338  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.292182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3468  alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
328 aa  335  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92927  normal  0.411159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.91 
 
 
328 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  51.07 
 
 
324 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.31 
 
 
326 aa  332  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  52.74 
 
 
325 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.46 
 
 
323 aa  331  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2235  alcohol dehydrogenase  50.91 
 
 
330 aa  328  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1228  alcohol dehydrogenase  50.61 
 
 
327 aa  328  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50 
 
 
326 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.15 
 
 
327 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  51.67 
 
 
324 aa  324  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3232  alcohol dehydrogenase  52.45 
 
 
331 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
326 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.99 
 
 
324 aa  322  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  51.67 
 
 
324 aa  322  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1715  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.15 
 
 
326 aa  322  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3853  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  49.08 
 
 
331 aa  317  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1264  alcohol dehydrogenase  52.47 
 
 
327 aa  317  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  48.32 
 
 
324 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 
325 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
325 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1429  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
323 aa  311  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  47.4 
 
 
325 aa  311  7.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  48.32 
 
 
324 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2619  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.54 
 
 
324 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869285  normal  0.466568 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.62 
 
 
324 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.71 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5834  quinone oxidoreductase (NADPH  51.53 
 
 
324 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.487323  normal  0.847734 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  47.4 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  47.4 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  47.4 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  47.4 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.4 
 
 
324 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  48.01 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  47.09 
 
 
324 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2841  alcohol dehydrogenase  48.63 
 
 
324 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397829  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1942  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.87 
 
 
323 aa  305  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.61 
 
 
323 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2949  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  48.61 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.92 
 
 
323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.4 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4146  quinone oxidoreductase, NADPH-dependent  50.16 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.768272  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.62 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2632  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.94 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.40031  decreased coverage  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.71 
 
 
324 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.92 
 
 
322 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
324 aa  299  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3028  alcohol dehydrogenase  49.24 
 
 
324 aa  299  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  47.09 
 
 
324 aa  298  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  50.15 
 
 
321 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4840  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.17 
 
 
326 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0102128  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2044  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.33 
 
 
324 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0482  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.85 
 
 
322 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3840  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.85 
 
 
323 aa  294  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00789848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1476  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  46.79 
 
 
323 aa  294  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
324 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  47.71 
 
 
324 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1585  alcohol dehydrogenase  47.26 
 
 
326 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>