277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4432 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  99.73 
 
 
367 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  99.73 
 
 
367 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  91.01 
 
 
367 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  100 
 
 
367 aa  748    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  99.73 
 
 
367 aa  746    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  99.73 
 
 
367 aa  746    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  90.74 
 
 
367 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  91.28 
 
 
367 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  91.28 
 
 
367 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  99.73 
 
 
367 aa  746    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  91.01 
 
 
367 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  99.46 
 
 
367 aa  745    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  99.46 
 
 
367 aa  745    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  99.73 
 
 
367 aa  746    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  88.28 
 
 
367 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  58.08 
 
 
368 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  58.33 
 
 
360 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.8 
 
 
364 aa  415  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  57.1 
 
 
360 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  52.96 
 
 
364 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  52.96 
 
 
364 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  49.31 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  49.86 
 
 
383 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  49.02 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.19 
 
 
380 aa  328  7e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  49.44 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  49.15 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  49.44 
 
 
369 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  49.15 
 
 
369 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  48.32 
 
 
365 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  50.28 
 
 
371 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3356  glycerol dehydrogenase  50.28 
 
 
371 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1019  glycerol dehydrogenase  50 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.556711  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  49.72 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  49.72 
 
 
371 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.58 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.34 
 
 
374 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  45.71 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
363 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 
383 aa  310  2.9999999999999997e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  45.18 
 
 
395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  47.16 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 
365 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.7 
 
 
373 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  45.58 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.04 
 
 
364 aa  300  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  42.25 
 
 
376 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.28 
 
 
368 aa  295  7e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.08 
 
 
385 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  40.88 
 
 
367 aa  273  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  43.33 
 
 
398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  39.83 
 
 
374 aa  240  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  38.57 
 
 
367 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  41.27 
 
 
365 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5662  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.96 
 
 
364 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.51 
 
 
363 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  35.69 
 
 
371 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.78 
 
 
373 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.42 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
360 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.94 
 
 
373 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.42 
 
 
385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.49 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1714  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
362 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.17 
 
 
367 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
377 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  33.99 
 
 
366 aa  169  1e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  34.37 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
396 aa  165  9e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0902  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 
373 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.84 
 
 
384 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.67 
 
 
360 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  29.94 
 
 
364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
378 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.8 
 
 
358 aa  153  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  33.61 
 
 
363 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  33.61 
 
 
363 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  33.61 
 
 
363 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  31.93 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  31.75 
 
 
362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  32.03 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  32.03 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  31.67 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  32.58 
 
 
366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  31.48 
 
 
362 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  31.75 
 
 
362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  31.48 
 
 
362 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  31.65 
 
 
362 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  29.07 
 
 
363 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  31.67 
 
 
362 aa  144  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  33.33 
 
 
417 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.48 
 
 
362 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  31.48 
 
 
362 aa  143  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  31.48 
 
 
362 aa  143  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  32.51 
 
 
361 aa  137  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  30.81 
 
 
363 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  29.36 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  33.43 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  35.71 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>