More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4249 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4249  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  100 
 
 
96 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03554  acetolactate synthase small subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0033  acetolactate synthase, small subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5103  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.094181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3883  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4037  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.662248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0029  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03496  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4179  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  97.92 
 
 
96 aa  197  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4021  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  88.54 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4126  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  88.54 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4005  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  88.54 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4184  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  88.54 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4076  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  88.54 
 
 
96 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0026  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  86.81 
 
 
95 aa  170  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0733  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  70.45 
 
 
97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.527542  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3814  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  63.04 
 
 
97 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  61.7 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.571883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3625  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  62.64 
 
 
103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0580  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  59.57 
 
 
97 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0286747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3075  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  54.17 
 
 
104 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0399  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  58.43 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1619  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  52.63 
 
 
103 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1949  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.422886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1838  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2288  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1882  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  58.33 
 
 
121 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2623  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  60.24 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1630  acetolactate synthase, small subunit  54.65 
 
 
96 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.582859  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0157  amino acid-binding ACT domain-containing protein  54.79 
 
 
130 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3616  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.93 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0012  acetolactate synthase, small subunit  47.89 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.046385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  43.66 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7781  acetolactate synthase, small subunit  46.38 
 
 
207 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.460716 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1444  acetolactate synthase, small subunit  38.2 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.336176  hitchhiker  0.00470003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3237  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.761628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3391  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.96 
 
 
184 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08880  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3579  acetolactate synthase, small subunit  35.16 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00517433  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18800  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.425298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.16 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2120  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.596226  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  44.93 
 
 
172 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000214698  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1091  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.03 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1901  acetolactate synthase, small subunit  37.66 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0148095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0591  acetolactate synthase, small subunit  43.48 
 
 
166 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000221035  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1164  acetolactate synthase, small subunit  42.03 
 
 
174 aa  58.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.686831  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0904  acetolactate synthase, small subunit  37.66 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.96493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0899  acetolactate synthase, small subunit  41.43 
 
 
167 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1709  acetolactate synthase, small subunit  39.13 
 
 
175 aa  58.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.529781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0719  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4072  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0707  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.68 
 
 
174 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2820  acetolactate synthase small subunit  39.13 
 
 
174 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08840  acetolactate synthase, small subunit  34.88 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.20928  normal  0.22405 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2517  acetolactate synthase, small subunit  36.36 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000223689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2434  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
172 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312888  normal  0.272193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000667629  hitchhiker  0.0000555489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2385  acetolactate synthase, small subunit  42.03 
 
 
173 aa  57.4  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.16 
 
 
170 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1071  acetolactate synthase, small subunit  42.03 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00570032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  40 
 
 
164 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2519  acetolactate synthase small subunit  36.62 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.23 
 
 
176 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2896  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 
171 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.386622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0694  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1876  acetolactate synthase, small subunit  36.05 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339514 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.29 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1990  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.14 
 
 
165 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1188  acetolactate synthase, small subunit  37.65 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2768  acetolactate synthase, small subunit  35.06 
 
 
221 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3639  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  42.03 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1409  acetolactate synthase, small subunit  39.13 
 
 
174 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.678038 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0111  acetolactate synthase, small subunit  34.12 
 
 
165 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.849988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  39.44 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1909  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.08 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2167  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.998104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0709  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0409  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  41.43 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  30.59 
 
 
169 aa  55.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13017  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.71 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0018972  normal  0.150654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.58 
 
 
163 aa  55.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2400  acetolactate synthase, small subunit  40.58 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10840  acetolactate synthase, small subunit  36.05 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
174 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3229  acetolactate synthase, small subunit  36.47 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3021  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 
166 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000136695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0543  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.57 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  37.33 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  37.33 
 
 
172 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.13 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1910  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  43.08 
 
 
163 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.370159  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  39.44 
 
 
164 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1241  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0418826 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0606  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.211278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.53 
 
 
172 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>