More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4103 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  98.99 
 
 		 693 aa  1401    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  98.85 
 
 		 693 aa  1399    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  98.85 
 
 		 693 aa  1400    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0697  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.19 
 
 		 832 aa  647    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.13 
 
 		 692 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.42 
 
 		 696 aa  935    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6122  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.71 
 
 		 691 aa  770    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.19 
 
 		 690 aa  861    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.66 
 
 		 691 aa  674    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  81.1 
 
 		 693 aa  1150    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.94 
 
 		 689 aa  969    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4976  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.43 
 
 		 697 aa  867    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0639  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 		 792 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.24 
 
 		 693 aa  967    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.84 
 
 		 688 aa  909    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0065  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.83 
 
 		 691 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0041  ATP-dependent DNA helicase RecG  81.24 
 
 		 693 aa  1146    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.01 
 
 		 691 aa  712    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  54.2 
 
 		 687 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.38589  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2015  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.44 
 
 		 690 aa  664    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.15 
 
 		 690 aa  662    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.12 
 
 		 691 aa  765    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.54 
 
 		 686 aa  768    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.6 
 
 		 691 aa  926    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2662  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.18 
 
 		 791 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.139193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4149  ATP-dependent DNA helicase RecG  82.11 
 
 		 693 aa  1146    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0087  ATP-dependent DNA helicase RecG  90.76 
 
 		 693 aa  1279    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  83.84 
 
 		 693 aa  1179    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4180  ATP-dependent DNA helicase RecG  81.24 
 
 		 693 aa  1146    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  81.82 
 
 		 693 aa  1144    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  57.31 
 
 		 712 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.36 
 
 		 691 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.14 
 
 		 704 aa  716    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 693 aa  1415    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.68 
 
 		 777 aa  649    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  98.85 
 
 		 693 aa  1400    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.57 
 
 		 696 aa  935    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.28 
 
 		 704 aa  718    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3256  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.02 
 
 		 703 aa  724    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.481232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.32 
 
 		 690 aa  711    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.28 
 
 		 696 aa  934    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  93.94 
 
 		 693 aa  1321    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  98.99 
 
 		 693 aa  1401    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4397  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.43 
 
 		 691 aa  774    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.338064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.57 
 
 		 696 aa  937    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1872  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.7 
 
 		 718 aa  676    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  93.94 
 
 		 693 aa  1323    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.83 
 
 		 693 aa  983    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.44 
 
 		 691 aa  910    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1798  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.55 
 
 		 718 aa  674    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.52 
 
 		 693 aa  1328    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3717  ATP-dependent DNA helicase RecG  55.8 
 
 		 695 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00158  ATP-dependent DNA helicase RecG  64.24 
 
 		 690 aa  885    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.23 
 
 		 686 aa  676    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.52 
 
 		 693 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3988  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.55 
 
 		 768 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3476  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.7 
 
 		 691 aa  900    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.35 
 
 		 697 aa  775    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4592  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.26 
 
 		 691 aa  903    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000346665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  60.23 
 
 		 691 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0112  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.23 
 
 		 699 aa  828    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.28 
 
 		 691 aa  927    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.01 
 
 		 696 aa  918    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.74 
 
 		 684 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0240  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 		 771 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  94.37 
 
 		 693 aa  1325    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  63.66 
 
 		 691 aa  899    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2283  ATP-dependent DNA helicase RecG  70 
 
 		 692 aa  939    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.26 
 
 		 693 aa  786    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.57 
 
 		 691 aa  937    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  99.86 
 
 		 693 aa  1413    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  62.91 
 
 		 693 aa  895    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0037  ATP-dependent DNA helicase RecG  81.39 
 
 		 693 aa  1148    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.28 
 
 		 696 aa  917    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.13 
 
 		 696 aa  915    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2440  ATP-dependent DNA helicase RecG  56.04 
 
 		 705 aa  712    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.446021  normal  0.13154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.84 
 
 		 705 aa  906    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  98.99 
 
 		 693 aa  1403    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0614  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.4 
 
 		 785 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70570  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.71 
 
 		 691 aa  771    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.28 
 
 		 692 aa  786    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  82.25 
 
 		 693 aa  1150    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.36 
 
 		 691 aa  800    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.28 
 
 		 692 aa  801    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.71 
 
 		 692 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0724  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.75 
 
 		 771 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.42 
 
 		 696 aa  921    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  99.57 
 
 		 693 aa  1410    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02362  ATP-dependent DNA helicase RecG  58.63 
 
 		 717 aa  740    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2523  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.16 
 
 		 740 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174099  normal  0.914241 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2338  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.17 
 
 		 747 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 		 684 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0356  ATP-dependent DNA helicase RecG  49.27 
 
 		 683 aa  633  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.73 
 
 		 684 aa  632  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0692  ATP-dependent DNA helicase RecG  53.03 
 
 		 773 aa  633  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153149  normal  0.329538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0469  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.66 
 
 		 678 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1280  ATP-dependent DNA helicase RecG  52.1 
 
 		 859 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1167  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.95 
 
 		 902 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.02 
 
 		 715 aa  628  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2575  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.95 
 
 		 902 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>