86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4051 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4051  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  100 
 
 		 341 aa  704    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  98.24 
 
 		 341 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  98.82 
 
 		 342 aa  691    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  98.83 
 
 		 341 aa  692    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4127  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  99.12 
 
 		 341 aa  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  98.83 
 
 		 341 aa  692    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  98.24 
 
 		 341 aa  691    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.41 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.41 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.41 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  43.09 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  43.09 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  38.12 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  40.43 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.94 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  37.01 
 
 		 337 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  38.58 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4042  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.09 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3998  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  35.22 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3997  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.09 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.321916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3936  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  35.22 
 
 		 337 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  39.09 
 
 		 336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4043  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.91 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3917  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.91 
 
 		 337 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.752434  normal  0.01081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4105  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  34.91 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0664462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3916  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  38.94 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620452  normal  0.010871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.12 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  33.75 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.75 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  33.75 
 
 		 338 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.44 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  33.53 
 
 		 338 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0078  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  32.41 
 
 		 339 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  33.44 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  31.39 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03437  hypothetical protein  51.02 
 
 		 167 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.27 
 
 		 326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  37.27 
 
 		 163 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  30.49 
 
 		 326 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2558  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  25 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  24.63 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  26.69 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 272 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2266  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 278 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1460  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0634  glycosyl transferase family 8  23.42 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.469103 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  27.71 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.56 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  26.1 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  20.96 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  23.13 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0753  glycosyl transferase family 8  21.83 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.833822  normal  0.756645 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2101  glycosyl transferase family 8  30 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.924704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  22.57 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  24.7 
 
 		 697 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  23.6 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1434  putative sugar transferase  25.39 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000727163  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  24.1 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0583  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  22.42 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  27.84 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_6525  predicted protein  23.55 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0939  glycosyl transferase family 8  24.36 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  26.44 
 
 		 602 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2060  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.939333  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  23.69 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  20.9 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  20.9 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1112  glycosyl transferase family 8  22.74 
 
 		 1014 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  25.53 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  23 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.08 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0704  glycosyl transferase family 8  23.47 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000224419  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0705  glycosyl transferase family 8  28.11 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000314752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0059  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.26 
 
 		 317 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  23.85 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0058  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.11 
 
 		 316 aa  42.7  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0031105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>