More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4048 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03478  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  98.77 
 
 
326 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3832  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  98.47 
 
 
323 aa  653    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000019224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0088  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  98.47 
 
 
323 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0341266  normal  0.158006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3958  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  97.55 
 
 
323 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0259947  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4124  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  97.55 
 
 
323 aa  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4048  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  100 
 
 
326 aa  673    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000904915  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0084  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  96.47 
 
 
319 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03429  hypothetical protein  98.67 
 
 
300 aa  608  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4994  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  94.55 
 
 
330 aa  607  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.041745  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3992  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  84.62 
 
 
317 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4037  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  84.29 
 
 
317 aa  547  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3911  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  84.29 
 
 
317 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0446452 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3930  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  83.97 
 
 
317 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4098  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  83.97 
 
 
317 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0115  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  80.56 
 
 
328 aa  535  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4371  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  73.27 
 
 
327 aa  479  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4090  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  73.4 
 
 
320 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4827  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  71.47 
 
 
323 aa  474  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0062  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  69.09 
 
 
321 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0223597  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0171  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  72.2 
 
 
322 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.425143  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0068  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  69.09 
 
 
321 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0575052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4148  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  69.09 
 
 
321 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3948  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  73.51 
 
 
323 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1611  ADP-heptose:LPS heptosyl transferase I  55.28 
 
 
321 aa  351  8e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0466  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  58.31 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44850  lipopolysaccharide heptosyltransferase I, waaC  57.14 
 
 
354 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.721697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0521  glycosyl transferase family protein  55.59 
 
 
354 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  56.08 
 
 
355 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.887327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66240  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  56.08 
 
 
354 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0370  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  56.95 
 
 
352 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.381359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  57.63 
 
 
352 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0342  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  56.61 
 
 
352 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.826178 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0367  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  56.61 
 
 
352 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5002  lipopolysaccharide heptosyltransferase  54.58 
 
 
354 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0580  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  55.15 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0447499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1516  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.83 
 
 
347 aa  289  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0753  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.39 
 
 
324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.171103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1428  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  43.12 
 
 
327 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4512  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  44.41 
 
 
314 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.935025  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1598  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  44.37 
 
 
314 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1610  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  44.07 
 
 
314 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.812323  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3771  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.36 
 
 
335 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145484  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1294  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.98 
 
 
314 aa  225  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1066  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.98 
 
 
314 aa  222  8e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1550  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.95 
 
 
357 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3928  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  45.27 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2266  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.65 
 
 
380 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.370229  normal  0.206331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0968  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.94 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0692  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  40.33 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00185807  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3700  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  41.1 
 
 
333 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0642  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.52 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.111821 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0921  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.68 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0601  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  41.18 
 
 
332 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100938  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2496  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  39.35 
 
 
357 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1490  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.86 
 
 
355 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3118  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.51 
 
 
355 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.145361  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0411  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  40.48 
 
 
350 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209214  hitchhiker  0.00110647 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3082  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.51 
 
 
331 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3141  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.51 
 
 
355 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0235  lipopolysaccharide heptosyltransferase 1  40.48 
 
 
350 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2190  heptosyltransferase I  38.51 
 
 
331 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.362399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2063  heptosyltransferase I  38.51 
 
 
331 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0184643  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0717  heptosyltransferase I  38.51 
 
 
355 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2551  heptosyltransferase I  38.51 
 
 
355 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2998  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.57 
 
 
353 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1640  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.61 
 
 
360 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0784  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.24 
 
 
331 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0773  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.91 
 
 
331 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263429  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4000  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.58 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0864  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.19 
 
 
331 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0415  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.19 
 
 
357 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0894  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.19 
 
 
357 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1109  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  36.49 
 
 
374 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2715  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  38.1 
 
 
363 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902664  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2108  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.62 
 
 
340 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0746  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  37.8 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1574  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.74 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.532477  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2636  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.29 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1976  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.29 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0804  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.29 
 
 
340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.575545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2963  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.45 
 
 
340 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3061  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.45 
 
 
340 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3028  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.45 
 
 
340 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0257  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
342 aa  170  3e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.36453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0949  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.59 
 
 
332 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0510  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.23 
 
 
332 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0989  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.23 
 
 
332 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0259349  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0849  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  35.82 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.727875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4092  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.31 
 
 
340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.102262  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0281  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.17 
 
 
352 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.93835  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0661  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.86 
 
 
336 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.796134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0861  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.98 
 
 
332 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.288239  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2410  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.45 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3421  putative lipopolysaccharide heptosyltransferase-1  32.27 
 
 
334 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2224  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.95 
 
 
340 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112899  normal  0.0907149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1060  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  30.97 
 
 
334 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.845943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  33.44 
 
 
353 aa  145  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0634  lipopolysaccharide heptosyltransferase protein  35.69 
 
 
332 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.415835  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3404  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  34.87 
 
 
351 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2331  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  32.7 
 
 
366 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000713254  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>