More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3529 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  98.84 
 
 		 472 aa  860    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  98.61 
 
 		 432 aa  860    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  98.61 
 
 		 432 aa  861    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  82.68 
 
 		 433 aa  740    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  98.61 
 
 		 432 aa  861    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  82.03 
 
 		 434 aa  739    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  83.41 
 
 		 433 aa  737    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  98.61 
 
 		 432 aa  861    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  98.84 
 
 		 472 aa  860    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  82.18 
 
 		 433 aa  731    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  83.41 
 
 		 434 aa  736    Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  100 
 
 		 432 aa  874    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  87.47 
 
 		 474 aa  770    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  83.41 
 
 		 434 aa  736    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  98.61 
 
 		 432 aa  861    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  98.84 
 
 		 432 aa  862    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  82.91 
 
 		 433 aa  744    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  81.82 
 
 		 432 aa  722    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  55.34 
 
 		 429 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  56.03 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  56.03 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  56.12 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  55.34 
 
 		 433 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  57.97 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0325  general substrate transporter:TonB box, N-terminal  54.67 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000282343  normal  0.265981 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  53.15 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  46.93 
 
 		 425 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 423 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  46.93 
 
 		 425 aa  425  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  48.85 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  51.16 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  45.75 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  45.75 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  45.75 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  45.75 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  45.75 
 
 		 434 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 443 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  49.18 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  50 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 430 aa  362  9e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  45.35 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  45.35 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2353  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1642  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.3142  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03520  conserved hypothetical protein  42.27 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03471  hypothetical protein  42.27 
 
 		 452 aa  347  3e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1611  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 433 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.585379  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  34.87 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  35.1 
 
 		 424 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 431 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 434 aa  229  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 449 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 439 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  33.26 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 432 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 432 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 427 aa  196  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 430 aa  196  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 441 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  30 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 430 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  29.41 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  29.58 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  28.64 
 
 		 480 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 445 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.97 
 
 		 446 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  28.72 
 
 		 442 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>