More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3369 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  99.6 
 
 
252 aa  517  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  99.6 
 
 
252 aa  517  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  99.6 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  99.6 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  99.6 
 
 
252 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  99.21 
 
 
252 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  90.87 
 
 
252 aa  477  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  90.48 
 
 
252 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  88.1 
 
 
252 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  74.6 
 
 
250 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  69.48 
 
 
250 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  69.48 
 
 
250 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  69.08 
 
 
250 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  67.87 
 
 
250 aa  351  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  68.67 
 
 
250 aa  323  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  62.25 
 
 
251 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  57.77 
 
 
253 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 
253 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 
253 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 
253 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  56.97 
 
 
253 aa  308  6.999999999999999e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  57.14 
 
 
254 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  57.14 
 
 
254 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  57.14 
 
 
254 aa  299  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  57.14 
 
 
254 aa  299  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  57.14 
 
 
254 aa  299  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  56.85 
 
 
262 aa  298  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  56.75 
 
 
254 aa  296  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  58.3 
 
 
254 aa  291  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  61.35 
 
 
251 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  61.57 
 
 
252 aa  285  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  58.15 
 
 
235 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  57.08 
 
 
252 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  55.1 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  57.08 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  58.52 
 
 
249 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  54.98 
 
 
253 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  54.18 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  54.18 
 
 
604 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  53.78 
 
 
253 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  52.59 
 
 
253 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  52.19 
 
 
253 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  56.71 
 
 
250 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  51.39 
 
 
254 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  53.74 
 
 
261 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  46.03 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  41.03 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  43.95 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  40.09 
 
 
290 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  36.11 
 
 
289 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 
269 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.52 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.8 
 
 
267 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  29.61 
 
 
270 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28.76 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  27.2 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 
365 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  28.12 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.36 
 
 
424 aa  82  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  32.02 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  30.74 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  28.69 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  31.45 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  25.1 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  31.27 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  28.23 
 
 
278 aa  79.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.77 
 
 
280 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  30.98 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  30.65 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.6 
 
 
292 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  28.27 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  26.91 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.1 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  25.57 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  30.53 
 
 
483 aa  75.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  28.08 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 
564 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 
588 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  26.48 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 
588 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  31.64 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  29.65 
 
 
533 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  35.06 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
593 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1773  putative metalloprotease  28.43 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.480116  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  31.64 
 
 
588 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.5 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  27.78 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  25.91 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.13 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>