More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3167 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02560  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  99.16 
 
 		 479 aa  1000    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.54657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0979  beta-lactamase domain protein  99.16 
 
 		 479 aa  1000    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00228257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0784  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  76.49 
 
 		 503 aa  783    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2846  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  98.75 
 
 		 479 aa  996    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3167  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  100 
 
 		 479 aa  1008    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2991  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  92.9 
 
 		 479 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69588  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02525  hypothetical protein  99.16 
 
 		 479 aa  1000    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3260  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  77.89 
 
 		 494 aa  815    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0437217  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  92.28 
 
 		 479 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2199  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.08 
 
 		 499 aa  749    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1002  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  99.16 
 
 		 479 aa  1000    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0118173  hitchhiker  0.000199326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4053  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  74.5 
 
 		 498 aa  777    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3149  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  92.69 
 
 		 479 aa  940    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0409708 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2833  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  98.96 
 
 		 479 aa  998    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0125184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3652  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  71.08 
 
 		 493 aa  763    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001301  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  69.34 
 
 		 500 aa  744    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.410803  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3042  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  92.9 
 
 		 479 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0301118 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1021  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  75.99 
 
 		 505 aa  810    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.527208  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3182  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  89.63 
 
 		 482 aa  910    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2994  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  99.37 
 
 		 479 aa  1001    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3960  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  98.96 
 
 		 479 aa  998    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1583  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  70.14 
 
 		 504 aa  758    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.652829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3033  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  82.89 
 
 		 485 aa  857    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.583429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3026  anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin  92.9 
 
 		 479 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000635155 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3699  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  61.01 
 
 		 402 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1203  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  59.26 
 
 		 405 aa  502  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1581  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  54.06 
 
 		 401 aa  464  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1187  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  54.82 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000111538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2871  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  53.55 
 
 		 397 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000136277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2180  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  53.06 
 
 		 397 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3642  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  51.28 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2942  metallo-beta-lactamase/flavodoxin domain-containing protein  50.77 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0065497  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0321  beta-lactamase domain protein  48.61 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0944004  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1287  Beta-lactamase-like  40.81 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705459 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0432  beta-lactamase domain-containing protein  40.69 
 
 		 404 aa  317  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2383  beta-lactamase-like protein  41.79 
 
 		 404 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3253  flavodoxin/nitric oxide synthase  39.39 
 
 		 397 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.233858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2265  beta-lactamase domain protein  38.79 
 
 		 407 aa  302  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0410  beta-lactamase domain-containing protein  38.54 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2821  beta-lactamase domain-containing protein  38.64 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000596505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2795  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  38.28 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000057389  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3294  rubredoxin-oxygen oxidoreductase, putative  38.35 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3243  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  37.59 
 
 		 404 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.39456  hitchhiker  0.0000871777 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0138  beta-lactamase domain protein  36.96 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.392817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2516  beta-lactamase domain protein  37.34 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.264357  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0323  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 392 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.625439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2654  flavodoxin/nitric oxide synthase  37.5 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1509  beta-lactamase domain-containing protein  37.12 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0425  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 		 387 aa  287  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0482  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 387 aa  285  9e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1554  beta-lactamase-like  39.27 
 
 		 410 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0457538  normal  0.358726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0202  beta-lactamase domain-containing protein  37.97 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0386  beta-lactamase domain-containing protein  36.45 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3353  flavoprotein A  38.17 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00104416  normal  0.102932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1153  beta-lactamase domain-containing protein  37.53 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.187317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0262  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 387 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0450  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.05 
 
 		 407 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22500  beta-lactamase domain protein  35.34 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000416658  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0063  beta-lactamase domain protein  37.28 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0456  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 		 407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0012  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.32 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.143481  normal  0.0465587 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3195  rubredoxin-oxygen oxidoreductase  37.37 
 
 		 418 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00034081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2480  beta-lactamase domain protein  37.5 
 
 		 394 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.877522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0457  flavodoxin/nitric oxide synthase  36.3 
 
 		 406 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2479  beta-lactamase domain protein  36.2 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2012  beta-lactamase domain protein  36.52 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000125952  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0955  beta-lactamase domain-containing protein  36.3 
 
 		 409 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.86403  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0339  beta-lactamase domain-containing protein  34 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000206565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2294  beta-lactamase domain protein  34.18 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000125791  hitchhiker  0.00000061463 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1132  beta-lactamase domain-containing protein  36.31 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  31.2 
 
 		 884 aa  231  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.46 
 
 		 878 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  32.08 
 
 		 508 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  31.46 
 
 		 878 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0399  beta-lactamase domain protein  33.08 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1451  Beta-lactamase-like:flavodoxin/nitric oxide synthase  34.73 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0284  metallo-beta-lactamase family protein  32 
 
 		 399 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0371  beta-lactamase domain-containing protein  33.59 
 
 		 395 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000174578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0275  metallo-beta-lactamase family flavodoxin  32 
 
 		 399 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2179  flavodoxin  32.4 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.438585  normal  0.181254 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0005  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 407 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0694  beta-lactamase domain protein  31.06 
 
 		 396 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2008  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  32.49 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1435  beta-lactamase domain protein  31.93 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0804  flavodoxin  35.42 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0783  metallo-beta-lactamase family protein  35.28 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0770  metallo-beta-lactamase family protein  35.69 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.226143  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1198  beta-lactamase domain-containing protein  32.31 
 
 		 384 aa  207  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.523487  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0286  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 		 398 aa  206  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0168  beta-lactamase domain protein  32.42 
 
 		 395 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000343113 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0004  rubredoxin:oxygen oxidoreductase, putative  31.12 
 
 		 407 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.351849  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2284  uncharacterized flavoprotein  33.69 
 
 		 411 aa  202  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0014767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0186  beta-lactamase domain protein  32.17 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.617182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0005  beta-lactamase domain protein  31.99 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0456333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.36 
 
 		 575 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.36 
 
 		 575 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1857  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.27 
 
 		 574 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0795  beta-lactamase-like  32.65 
 
 		 395 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0893314  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0232  flavodoxin  30.58 
 
 		 401 aa  197  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3191  hypothetical protein  31.3 
 
 		 431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>