124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3091 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  100 
 
 
111 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  99.1 
 
 
111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  99.1 
 
 
111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  99.1 
 
 
111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  99.1 
 
 
111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  99.1 
 
 
111 aa  230  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  98.2 
 
 
111 aa  228  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  98.2 
 
 
111 aa  227  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  99.03 
 
 
103 aa  214  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  53.27 
 
 
108 aa  130  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  53.77 
 
 
110 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  52.25 
 
 
113 aa  115  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  49.53 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  50.47 
 
 
115 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.75 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  47.75 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.73 
 
 
116 aa  106  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  45.37 
 
 
111 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.19 
 
 
109 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.9 
 
 
110 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.51 
 
 
116 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.27 
 
 
120 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.9 
 
 
124 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.32 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.68 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.68 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.58 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4869  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.56 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.536474  unclonable  0.0000000999645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.58 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.19 
 
 
119 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3307  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  60.87 
 
 
48 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  34.78 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
118 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  31.52 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  31.43 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5124  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.65 
 
 
108 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.61 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3598  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.5 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4478  toxin ChpB  39.81 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4794  toxin ChpB  39.81 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5742  toxin ChpB  39.81 
 
 
116 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4703  toxin ChpB  39.81 
 
 
116 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.01 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0890  toxin ChpB  31.13 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  33.7 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3376  toxin ChpB  37.5 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00160549  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5698  toxin ChpB  39.36 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.783517  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  36.84 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0771  toxin ChpB  34.69 
 
 
115 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1479  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.52 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.937669  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  29.81 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  32.29 
 
 
114 aa  53.9  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4418  toxin ChpB  34.04 
 
 
115 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751601  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.63 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2583  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.77 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.1 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.74 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.22 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2885  PemK family protein  32.97 
 
 
127 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.670266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
123 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
111 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.42 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.79 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  39.76 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.55 
 
 
72 aa  50.4  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.36 
 
 
170 aa  50.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.18 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0164  stable plasmid inheritance protein PemK  30.68 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000268925  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  32.11 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.88 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  28.72 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.38 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.8 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3768  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.56 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.68 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21830  growth inhibitor  33.67 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000451152  normal  0.350233 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.62 
 
 
116 aa  47  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.21 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.41 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.18 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  28.87 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9913  plasmid stable inheritance protein K  33.73 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.703725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.92 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4177  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.39 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.150234  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  31.51 
 
 
110 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  27.84 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.49 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.85 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.47 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.78 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.85 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2866  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.134272  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.85 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.93 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0572  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.84 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.42 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>