298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2987 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  761    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  99.73 
 
 
373 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  761    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  95.7 
 
 
373 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  95.43 
 
 
373 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3483  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.13 
 
 
373 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.250939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  761    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  761    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  99.73 
 
 
373 aa  759    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  100 
 
 
373 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  99.73 
 
 
373 aa  760    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  761    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3356  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.13 
 
 
373 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  95.43 
 
 
373 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3079  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  90.62 
 
 
373 aa  702    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.394407  normal  0.0294046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.4 
 
 
373 aa  674    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  95.16 
 
 
373 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0880  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.33 
 
 
373 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.404976  normal  0.139237 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.86 
 
 
373 aa  674    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  95.7 
 
 
373 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2854  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  85.79 
 
 
373 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0998  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  86.56 
 
 
372 aa  639    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  87.13 
 
 
373 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  65.77 
 
 
375 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
375 aa  521  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  64.59 
 
 
375 aa  508  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  65.77 
 
 
377 aa  505  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  61.79 
 
 
375 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.54 
 
 
374 aa  457  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.87 
 
 
383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1215  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
383 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000459834  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.8 
 
 
379 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
383 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0378227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.06 
 
 
379 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.33 
 
 
379 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
379 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1054  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
384 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.189276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
379 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.53 
 
 
379 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.06 
 
 
383 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  58.11 
 
 
384 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3012  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 
379 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0411144  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  56.72 
 
 
379 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.76 
 
 
375 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 
383 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01712  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  53.64 
 
 
384 aa  415  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.149825  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2749  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  57.26 
 
 
384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.186478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3953  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  52.86 
 
 
381 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23140  chorismate mutase, clade 2  44.48 
 
 
706 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.839893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2269  Prephenate dehydrogenase  33.71 
 
 
371 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00760536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1560  prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 
276 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1033  prephenate dehydrogenase  32.68 
 
 
274 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.393372  normal  0.590632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1300  prephenate dehydrogenase  34.34 
 
 
274 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.580426  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0599  hypothetical protein  31.8 
 
 
288 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0114109  normal  0.0489829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1946  prephenate dehydrogenase  31.37 
 
 
279 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.772286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1024  prephenate dehydrogenase  30.66 
 
 
447 aa  137  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2608  Prephenate dehydrogenase  31.47 
 
 
283 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.749464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  29.86 
 
 
439 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0924  prephenate dehydrogenase  28.52 
 
 
505 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  29.35 
 
 
443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.5 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0827  prephenate dehydrogenase  27.9 
 
 
439 aa  126  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.666183  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1997  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 
437 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1502  prephenate dehydrogenase  31.27 
 
 
288 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3767  prephenate dehydrogenase  32.76 
 
 
242 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000142598  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6599  chorismate mutase  29.11 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1648  hypothetical protein  22.69 
 
 
351 aa  106  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0329926 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2473  prephenate dehydrogenase  29.44 
 
 
258 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.413514  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4586  Prephenate dehydrogenase  25.09 
 
 
294 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1747  Prephenate dehydrogenase  28.2 
 
 
263 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0437  prephenate dehydrogenase  28.96 
 
 
288 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000137716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2811  Prephenate dehydrogenase  29.27 
 
 
259 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0118  Prephenate dehydrogenase  24.61 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0460  prephenate dehydrogenase  26.22 
 
 
287 aa  89.7  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000113439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1510  prephenate dehydrogenase  26.28 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1453  prephenate dehydrogenase  25.91 
 
 
373 aa  84  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.542491  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1877  chorismate mutase / prephenate dehydrogenase  29.58 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.786603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  26.53 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_403  prephenate dehydrogenase  25.76 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0334  Prephenate dehydrogenase  27.42 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1605  prephenate dehydrogenase  26.98 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.294712  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1368  Prephenate dehydrogenase  32.29 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3485  prephenate dehydrogenase  30.77 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0545  prephenate dehydrogenase  22.71 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01188  prephenate dehydrogenase  27.75 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0972  prephenate dehydrogenase  34.13 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.161395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0026  chorismate mutase  43.06 
 
 
96 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630084  normal  0.0206275 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  40 
 
 
107 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3617  chorismate mutase  43.59 
 
 
110 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.76 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0997  prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
237 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119392  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1182  cyclohexadienyl dehydrogenase  24.89 
 
 
311 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0393  arogenate dehydrogenase  25.76 
 
 
313 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0833829  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1274  prephenate dehydrogenase  32.54 
 
 
245 aa  57.8  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.885753  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  34.41 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2024  prephenate dehydrogenase  30.23 
 
 
250 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  52 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3139  prephenate dehydrogenase  23.5 
 
 
285 aa  56.6  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  25.62 
 
 
319 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0631  chorismate mutase  42.31 
 
 
115 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.485034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>