More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2871 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  94.59 
 
 		 429 aa  792    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  94.59 
 
 		 429 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  83.29 
 
 		 429 aa  710    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  88.32 
 
 		 428 aa  751    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  88.34 
 
 		 429 aa  751    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  100 
 
 		 429 aa  837    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  86.95 
 
 		 429 aa  747    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  82.75 
 
 		 429 aa  698    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  94.35 
 
 		 429 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  86.95 
 
 		 429 aa  746    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  99.53 
 
 		 429 aa  834    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  99.77 
 
 		 429 aa  836    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  94.82 
 
 		 429 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  91.53 
 
 		 429 aa  779    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  94.35 
 
 		 429 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  88.32 
 
 		 428 aa  751    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  66.2 
 
 		 422 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  59.3 
 
 		 433 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  61.63 
 
 		 428 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  54.81 
 
 		 458 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  57.25 
 
 		 432 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  57 
 
 		 432 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  50.86 
 
 		 420 aa  399  9.999999999999999e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  50.25 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  53.3 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  49.03 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  49.03 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  49.28 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  51.97 
 
 		 391 aa  372  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  46.44 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  45.63 
 
 		 438 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  45.63 
 
 		 438 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  45.63 
 
 		 427 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  45.63 
 
 		 438 aa  362  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  45.63 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  45.63 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  45.63 
 
 		 427 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  45.63 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  44.47 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  45.5 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  49.51 
 
 		 434 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  45.66 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  45.39 
 
 		 427 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  45.95 
 
 		 423 aa  352  7e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  44.65 
 
 		 432 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  44.98 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  42.33 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  44.5 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  44.5 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  44.23 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  44.06 
 
 		 423 aa  322  9.000000000000001e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  42.82 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  44.31 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  43.15 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0108  uracil-xanthine permease  40.72 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.12338  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0107  uracil-xanthine permease  40.72 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.681241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  43.66 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  40 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  42.08 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0556  uracil permease  40.92 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  38.89 
 
 		 421 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  39.75 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  39.75 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  39.31 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1980  uracil-xanthine permease  41.49 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  39.55 
 
 		 427 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  40.98 
 
 		 411 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  38.63 
 
 		 409 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  39.95 
 
 		 406 aa  276  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 425 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  39.75 
 
 		 424 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  38.44 
 
 		 441 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  39.34 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  38.5 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0068  uracil-xanthine permease  40.59 
 
 		 428 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  39.45 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  40.72 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  39.32 
 
 		 416 aa  273  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  37.98 
 
 		 417 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  39.14 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  37.74 
 
 		 417 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  39.69 
 
 		 425 aa  269  8e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  38.57 
 
 		 425 aa  269  8e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  39.71 
 
 		 441 aa  268  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0252  xanthine/uracil permease family protein  38.93 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.159072  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  40.62 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  38.82 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  37.53 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1918  uracil-xanthine permease  40.66 
 
 		 409 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00881195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00930  uracil-xanthine permease  40.1 
 
 		 445 aa  262  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0086  uracil-xanthine permease  37.41 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0945  uracil-xanthine permease  39.84 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2162  uracil-xanthine permease  39.1 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>