More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2738 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2738  DNA-binding transcriptional activator EvgA  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2506  DNA-binding transcriptional activator EvgA  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00265649  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1300  DNA-binding transcriptional activator EvgA  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2655  DNA-binding transcriptional activator EvgA  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2519  DNA-binding transcriptional activator EvgA  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3600  DNA-binding transcriptional activator EvgA  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0441797 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02240  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02279  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with EvgS  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1288  two component transcriptional regulator, LuxR family  99.51 
 
 
204 aa  414  1e-115  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0304  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 
207 aa  157  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12780  putative two-component response regulator  37.07 
 
 
209 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.36161e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1160  putative two-component response regulator  36.59 
 
 
209 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24710  putative two-component response regulator  38.61 
 
 
207 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2093  putative two-component response regulator  38.61 
 
 
207 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2781  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 
204 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4151  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.44 
 
 
208 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35782  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3890  LuxR response regulator receiver  37.44 
 
 
208 aa  148  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4515  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
208 aa  147  1e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0174  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.64 
 
 
208 aa  146  2e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1119  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
208 aa  145  4e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4322  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
207 aa  144  8e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
236 aa  143  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.796271  normal  0.799889 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1090  LuxR family DNA-binding response regulator  34.48 
 
 
207 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3638  two component LuxR family transcriptional regulator  35.18 
 
 
205 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
205 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.003137  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3974  two component LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
208 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2101  LuxR family DNA-binding response regulator  35.18 
 
 
207 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00862279  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2160  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 
210 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2269  two component LuxR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
210 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2114  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 
212 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  35.64 
 
 
207 aa  140  1e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  35.64 
 
 
207 aa  140  1e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2113  LuxR family DNA-binding response regulator  35.44 
 
 
210 aa  139  2e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1620  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
206 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0222153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4334  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
209 aa  135  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255025  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2528  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
204 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2350  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
204 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  36.1 
 
 
232 aa  133  1e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5714  two component LuxR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
210 aa  133  1e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3412  LuxR family DNA-binding response regulator  33.17 
 
 
204 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0598  transcriptional regulator FimZ  33.66 
 
 
210 aa  132  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.110504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0595  transcriptional regulator FimZ  33.66 
 
 
210 aa  132  4e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.447967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0602  transcriptional regulator FimZ  32.2 
 
 
210 aa  131  7e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.0923244 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0659  transcriptional regulator FimZ  32.2 
 
 
210 aa  131  7e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0594  transcriptional regulator FimZ  32.2 
 
 
210 aa  131  7e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627077  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5940  LuxR family response regulator  34.13 
 
 
220 aa  127  1e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  7.81929e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4331  two component LuxR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
212 aa  125  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.748519  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
203 aa  124  8e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6866  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 
202 aa  124  8e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140006  normal  0.169631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3087  transcriptional regulator FimZ  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0580  transcriptional regulator FimZ  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0610  transcriptional regulator FimZ  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0636  transcriptional regulator FimZ  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.931873  normal  0.250092 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00485  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0577  transcriptional regulator FimZ  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00490  hypothetical protein  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3078  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.34 
 
 
210 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0993  transcriptional regulator FimZ  32.35 
 
 
210 aa  121  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 
217 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5536  LuxR response regulator receiver  33.96 
 
 
209 aa  120  1e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.882777  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
208 aa  119  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2928  two component LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
213 aa  119  4e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0462  transcriptional regulator FimZ  31.96 
 
 
199 aa  117  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.739138  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6883  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 
213 aa  116  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239531  normal  0.170628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1863  two component LuxR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
209 aa  114  1e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1808  two component LuxR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
207 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000516369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 
210 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  31.71 
 
 
210 aa  110  1e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 
210 aa  109  2e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.32 
 
 
221 aa  109  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4449  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
230 aa  108  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.683214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
228 aa  108  8e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3789  response regulator receiver  30.1 
 
 
228 aa  107  9e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
214 aa  107  9e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1400  two component signal transduction response regulator  34.48 
 
 
214 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1909  response regulator receiver protein  31.43 
 
 
220 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.631594  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  31.86 
 
 
219 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
213 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2019  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.73 
 
 
223 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  31.86 
 
 
219 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
214 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
213 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
222 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 
215 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3790  two component LuxR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
226 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4035  two component LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
228 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2401  response regulator receiver  28.16 
 
 
230 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0808908 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
210 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2246  two component LuxR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
214 aa  104  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0703025  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0459  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
207 aa  104  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957088  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4335  two component LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
194 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  28.43 
 
 
209 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
213 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
212 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 
218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.71 
 
 
218 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0855  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
223 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.082304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
211 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2177  response regulator receiver protein  30.46 
 
 
220 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.430622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01515  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  31.75 
 
 
215 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>