More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2419 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00913  predicted peptidase with chaperone function  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.297471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00920  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.297268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1015  M48B family peptidase  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2211  M48B family peptidase  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000159617  normal  0.373836 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1006  M48B family peptidase  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1070  peptidase, M48B family  100 
 
 		 262 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000805539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2419  peptidase, M48B family  100 
 
 		 235 aa  482  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000823036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2687  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 254 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  0.800439 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2734  peptidase M48 Ste24p  99.57 
 
 		 254 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000015723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1044  peptidase M48, Ste24p  71 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330667  normal  0.397377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0985  peptidase M48, Ste24p  71 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1012  peptidase M48, Ste24p  71 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.453448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1092  peptidase M48, Ste24p  71 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000219795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1077  peptidase M48, Ste24p  71 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.676639  normal  0.12014 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3351  M48 family peptidase  62.23 
 
 		 250 aa  310  1e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3955  peptidase M48 Ste24p  62.45 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0845  M48 family peptidase  61.8 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0849  peptidase M48 Ste24p  61.8 
 
 		 250 aa  309  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.322576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3704  peptidase M48 Ste24p  62.45 
 
 		 250 aa  294  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3239  peptidase M48, Ste24p  59.91 
 
 		 252 aa  288  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3315  peptidase M48, Ste24p  59.91 
 
 		 252 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02766  predicted peptidase  58.15 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3369  peptidase, M48B family  58.15 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.433794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3078  M48B family peptidase  58.15 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3270  M48B family peptidase  58.15 
 
 		 252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4238  peptidase, M48B family  58.15 
 
 		 252 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3094  M48B family peptidase  57.71 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0775  peptidase M48 Ste24p  57.71 
 
 		 252 aa  282  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0200008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0758  peptidase M48 Ste24p  57.71 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3335  peptidase M48 Ste24p  60.09 
 
 		 252 aa  278  4e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.490632  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2547  peptidase M48 Ste24p  56.77 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0353  putative lipoprotein  62.5 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3342  peptidase M48, Ste24p  58.67 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.887566  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3901  peptidase M48 Ste24p  61.57 
 
 		 250 aa  271  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03610  putative putative Zn-dependent protease with chaperone function  61.61 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00852154  hitchhiker  0.000000000112328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2849  peptidase M48, Ste24p  56.76 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2139  peptidase M48, Ste24p  59.01 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.821135  normal  0.237268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2807  peptidase M48, Ste24p  56.77 
 
 		 253 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6085  peptidase M48, Ste24p  57.21 
 
 		 253 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2706  peptidase M48, Ste24p  55.76 
 
 		 250 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.268844  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2674  peptidase M48 Ste24p  55.9 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2779  peptidase M48 Ste24p  57.21 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2755  peptidase M48, Ste24p  57.21 
 
 		 253 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2142  peptidase M48, Ste24p  55.9 
 
 		 604 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0546  peptidase M48 Ste24p  55.02 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.786234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1960  peptidase M48, Ste24p  57.21 
 
 		 250 aa  234  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2648  peptidase M48 Ste24p  54.5 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0474  peptidase M48, Ste24p  52.44 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0489  peptidase M48 Ste24p  46.08 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0533108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0117  peptidase M48, Ste24p  41.36 
 
 		 275 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0226  peptidase M48, Ste24p  42.92 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.303922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1855  Zn-dependent protease with chaperone function-like  38.39 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0553216  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2098  peptidase M48 Ste24p  39.74 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.380945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0225  peptidase M48, Ste24p  41.78 
 
 		 290 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 		 424 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.66 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  33.15 
 
 		 445 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.71 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 		 447 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  28.86 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 		 365 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  31.49 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  27.31 
 
 		 453 aa  75.5  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.04 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  26.49 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  31.41 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  29.45 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  22.86 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  29.32 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  26.18 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  25.32 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  27.98 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  26.18 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  25.52 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  26.9 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.09 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  26.42 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  25.11 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.73 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  28.71 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  25.23 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  29.03 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.09 
 
 		 565 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  27.68 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  31.61 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  31.75 
 
 		 423 aa  68.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 483 aa  68.6  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  28.85 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  26.56 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  32.26 
 
 		 354 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  27.5 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2222  peptidase M48 Ste24p  33.75 
 
 		 445 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  30.32 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  26.71 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  28.63 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.85 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>