39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2355 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  99.12 
 
 		 209 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124441  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  99.12 
 
 		 209 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000316322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  99.12 
 
 		 209 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  0.000000482749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  99.12 
 
 		 209 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000143241  normal  0.451422 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  99.12 
 
 		 209 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000055454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  99.12 
 
 		 209 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000094765  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  99.12 
 
 		 209 aa  231  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000688807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  98.25 
 
 		 209 aa  228  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144107  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  72.12 
 
 		 201 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  72.12 
 
 		 201 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  72.12 
 
 		 201 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  72.12 
 
 		 201 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  72.12 
 
 		 201 aa  159  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  50 
 
 		 208 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000187987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  46.08 
 
 		 208 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000067417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  39.42 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  50 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000064968  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  50 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000195264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  39.39 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000863171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  38.38 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  42.35 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000590312  hitchhiker  0.0000249336 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  38.96 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  37.04 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  36.36 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  40 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  36.78 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  41.56 
 
 		 202 aa  51.6  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  35.48 
 
 		 195 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  33.33 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  38.1 
 
 		 238 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000335694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  26.97 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241401  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4549  TfoX domain-containing protein  26.97 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000271318  decreased coverage  0.00000000740957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4685  hypothetical protein  26.97 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000564607  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  27.96 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0749  TfoX domain-containing protein  27.59 
 
 		 92 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282068  decreased coverage  0.000000000000743098 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>